Trichohepatoenteric综合征;SKI2-Like RNA解旋酶

Lee等(1995)鉴定了与酵母核仁蛋白基因SKI2具有序列同源性的人cDNA。SKI2属于6个酵母基因,可抑制单链和双链RNA病毒的拷贝数。Lee等(1995)通过用针对牛有色视网膜细胞的单克隆抗体免疫筛选表达文库来鉴定cDNA。该抗体识别许多物种中的90 kD核抗原。

细胞遗传学位置:6p21.33
基因座标(GRCh38):6:31,959,156-31,969,851

Gene-Phenotype Relationships
Location Phenotype Phenotype
MIM number
Inheritance Phenotype
mapping key
6p21.33 Trichohepatoenteric syndrome 2 614602 AR 3

解旋酶参与DNA复制,DNA修复,重组,转录,RNA剪接和翻译。Dangel等(1995)克隆了一个假定的人类解旋酶,他们命名为SKI2W,位于RD基因(154040)和他们称为RP1的基因之间(D6S60E;参见Shen等,1994)位于第6号染色体上主要组织相容性复合体的III类区域。该基因出现在RD和RP1之间大约11 kb的范围内。从一组淋巴细胞文库中分离出cDNA,预测的1,246个氨基酸蛋白(137 kD)包含与RNA解旋酶相关的基序,并具有亮氨酸拉链结构域。该蛋白质与酵母Ski2p基因具有广泛的相似性(39%相同性),后者与抑制非聚腺苷酸RNA的翻译有关,并且在防御单链和双链RNA病毒的感染中起重要作用。作者表明,重组SKI2W蛋白具有ATPase活性。Northern印迹表明在多种人类转化株中有一个3.9kb的转录本。Dangel等(1995)他说这个基因的序列与李等人报道的序列非常相似(1995年),这两个序列之间的差异可能是克隆伪像的结果。

内在不稳定的哺乳动物mRNA在其3个主要非翻译区域内包含富含AU的元件(ARE)。在酵母中,3-prime至5-​​prime mRNA的降解是由外泌体(一种多亚基颗粒)介导的。Chen等(2001)通过质谱法纯化和表征了人类的外泌体,发现其组成与酵母相似。他们确定了人类外泌体中的以下蛋白质亚基:与酵母Rrp4蛋白(602238)同源的p7 ;p8,其与酵母Rrp42蛋白同源(606488);p9,其与酵母Rrp43蛋白(OIP2;606019)同源;p10,与酵母Rrp40蛋白同源(606489); p11,其与酵母Mtr3蛋白同源(606490);p12A,其与酵母Rrp41蛋白同源(606491);p12B,其与酵母Rrp46蛋白同源(606492);p13,与酵母Csl4蛋白同源(606493)。他们还确定了2个与外泌体相关的因子p1(SKIV2L)和p14(MPP6; 605500),它们与任何酵母外泌体成分都不同源。

▼ 基因结构
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通过基因组序列分析,Yang等(1998)确定SKIV2L是一个跨越11 kb的多态性基因,包含28个外显子。

▼ 测绘
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Lee等(1995)分离了基因组克隆,并通过荧光原位杂交将SKI2基因的人类同源物定位到6p21。通过基因组序列分析,Yang等(1998)确定SKIV2L基因位于RD基因下游171bp。

▼ 基因功能
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Chen等人使用无细胞RNA衰变系统(2001)证明哺乳动物外泌体是包含ARE的RNA的快速降解所必需的,而不是poly(A)缩短所必需的。他们发现哺乳动物的外泌体自身无法识别含ARE的RNA。ARE识别需要某些ARE结合蛋白,这些蛋白可以与外泌体相互作用并将其募集到不稳定的RNA,从而促进其快速降解。

▼ 分子遗传学
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Fabre等人在6例不相关的典型的T型肝胆肠综合症患者(THES2; 614602)中,其TTC37基因突变为阴性(614589)(2012)测序的基因的候选基因SKIV2L并鉴定纯合性或杂合性化合物为8个不同的突变,分别在所有患者(见,例如,600478.0001 - 600478.0003)。可用于分析的所有未受影响的父母均为其子女中鉴定出的一种突变的杂合子。

▼ 等位基因变异体(3个示例):
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.0001肝磷脂肠综合症2
SKIV2L,TRP283TER
Fabre等人在法国患有肝胆肠综合症(THES2; 614602)的患者中(2012)确定了SKIV2L基因中c.848G-A过渡(c.848G-A,NM_006929.4)的化合物杂合性,导致trp283-to-ter(W283X)取代和c.1022T-G转换,导致val341-gly(V341G; 600478.0002)取代。

.0002 TRICHOHEPATOENTERIC综合征2
SKIV2L,VAL341GLY
为了讨论SKIV2L基因中的c.2572del突变(c.2572del,NM_006929.4),导致val341-to-gly(V341G)取代,该变异在患有三型肝肠综合症(THES2)的患者中呈复合杂合状态; 614602)由Fabre等人撰写(2012),请参阅600478.0001。

.0003肝胰肠综合征2
SKIV2L,1-BP INS,1635A
Fabre等人在一名北非肝胆肠综合症2(THES2; 614602)患者中发现了这种情况(2012年)确定了SKIV2L基因中1 bp插入的纯合性(c.1635insA,NM_006929.4),导致移码预计导致了提前终止密码子(Gly546ArgfsTer35)。