低髓鞘性白细胞营养不良 ;精氨酸-tRNA合成酶1

RARS基因编码精氨酸的细胞质tRNA合成酶ArgRS,它是多酶氨酰基-tRNA合成酶复合物的一个组成部分(Wolf等人,2014年摘要)。

细胞遗传学位置:5q34
基因座标(GRCh38):5:168,486,470-168,519,300

Gene-Phenotype Relationships
Location Phenotype Phenotype
MIM number
Inheritance Phenotype
mapping key
5q34 Leukodystrophy, hypomyelinating, 9 616140 AR 3

▼ 克隆和表达
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Girjes等(1995)分离了对应于RARS基因的全长cDNA,并确定了一个与其他哺乳动物RARS具有87%同源性的1983个核苷酸的开放解读码组。Northern印迹分析显示存在约2.2kb的单个mRNA种类。

▼ 基因功能
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使用秀丽隐杆线虫的前向遗传筛选,安德森等(2009年)分离了rrt1的一个耐缺氧功能降低的突变体(其人类同源物为RARS1),该突变体编码精氨酸转移RNA合成酶,该酶是蛋白质翻译所必需的酶。敲低rrt1以及编码氨酰tRNA合成酶的大多数其他基因,使动物摆脱了由缺氧引起的死亡,并且耐缺氧性水平与翻译率成反比。缺氧诱导了未折叠的蛋白反应,是rrt1功能降低突变体的低氧耐受性所必需的。因此,安德森等(2009)的结论是,翻译抑制产生缺氧耐受性,部分原因是减少了展开蛋白毒性。

▼ 测绘
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Arfin等(1985)通过研究体细胞杂种,将精氨酰-tRNA合成酶的基因分配给了5号染色体。当时映射的7个氨酰基-tRNA合成酶基因中,有4个位于5号染色体上,仅占人类总基因组的7%。

▼ 分子遗传学
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Wolf等人在来自荷兰的3个无关家庭的4名患者中出现了髓鞘低性白质营养不良9(HLD9; 616140)(2014)在RARS基因鉴定的化合物杂合子突变(107820.0001 - 107820.0005)。通过全外显子组测序发现了两个家族的突变,并通过Sanger测序证实。所有患者均携带1个错义突变,且该突变预计会导致反式功能蛋白的丢失;没有进行变体的功能研究。所有患者均在生命的第一年出现下肢严重痉挛,上肢轻度痉挛,眼球震颤和智力低下。脑部成像与影响上,下肌腱鞘区域的髓鞘减少有关。总体表型的严重程度是可变的。

Nafisinia等人在一个由无亲缘的马耳他父母所生的患有9例低髓鞘性白细胞营养不良的姐妹和兄弟中(2017)确定了沃尔夫等人先前在HLD9患者中报告的RARS基因突变之一(D2G; 107820.0001)的纯合性(2014年)。该突变通过全外显子组测序发现,并通过Sanger测序证实,与该家族的疾病分离。Nafisinia等人使用RARS基因的所有15个外显子的Sanger测序(2017)筛选了45例没有分子诊断的低髓鞘性疾病患者,并鉴定了一名男性患者,该患者出生于土耳其的堂兄表亲,在RARS基因中具有复合杂合突变(107820.0006- 107820.0007)。Nafisinia等人使用受影响的同胞之一的成纤维细胞提取物(2017)发现,RARS蛋白质及其组装的多RNA合成酶复合物的水平显着降低。

▼ 等位基因变异体(7个示例):
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.0001白血病,髓鞘增生,9
RARS1,ASP2GLY
Wolf等人在荷兰的2个姐妹中出现了髓鞘减少性白细胞营养不良9(HLD9; 616140)(2014年)确定了RARS基因中的复合杂合突变:外显子1中出现了c.5A-G过渡(c.5A-G,NM_002887.3),导致了从asp2到gly(D2G)的替换,以及一个G外显子1供体剪接位点的从T到T的转化(c.45 + 1G-T; 107820.0002),预计会导致规范剪接位点的丢失。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过Sanger测序证实的,与该家族的疾病分离。针对dbSNP(内部版本137),1000 Genomes Project和Exome Variant Server数据库过滤了变体。D2G取代位于RARS整合到多tRNA合成酶复合物中所必需的72个氨基酸域中。来自荷兰的另一个具有相似表型的孩子是D2G的复合杂合子和第2外显子的2 bp缺失(c.96_97del),导致移码和过早终止(Cys32TrpfsTer39; 107820.0003)。

Nafisinia等人在HLD9的无亲属马耳他父母的兄弟姐妹中生(2017)确定了RARS基因中D2G突变的纯合性。来自其中一个同胞的成纤维细胞提取物显示,其组装的RARS蛋白和多RNA合成酶复合物的水平显着降低。

.0002白血病,髓鞘增生,9
RARS1,IVS1DS,GT,+ 1
为了讨论RARS基因(c.45 + 1G-T,NM_002887.3)的剪接位点突变,该突变是Wolf等人在2个具有低髓鞘性白细胞营养不良9(HLD9; 616140)的姐妹中以复合杂合状态发现的(2014),请参阅107820.0001。

.0003白细胞增生,髓鞘增生,9
RARS1,2-BP DEL,NT96
为了讨论RARS基因(c.96_97del,NM_002887.3)中2 bp缺失的问题,Wolf等人在患有低髓鞘性白细胞营养不良9(HLD9; 616140)的患者中发现了复合杂合状态(2014),请参阅107820.0001。

.0004白细胞增生,髓鞘增生,9
RARS1,MET1?
Wolf等人在荷兰的一名儿童中出现了髓鞘减少性白细胞营养不良9(HLD9; 616140)(2014)确定了RARS基因中的复合杂合突变:影响起始密码子的外显子1中出现c.1A-G过渡(c.1A-G,NM_002887.3),外显子13中出现c.1535G-A过渡以arg512-to-gln(R512Q; 107820.0005)取代核心域中高度保守的残基。这些突变是通过全外显子组测序发现并通过Sanger测序证实的,与该家族的疾病隔离开来。针对dbSNP(内部版本137),1000 Genomes Project和Exome Variant Server数据库过滤了变体。

.0005白血病,髓鞘增生,9
RARS1,ARG512GLN
为了讨论RARS基因第13外显子中c.1535G-A的转变(c.1535G-A,NM_002887.3),导致arg512到gln(R512Q)的取代,该杂合状态为Wolf等人的患有低髓鞘性白细胞营养不良9(HLD9; 616140)的患者(2014),请参阅107820.0004。

.0006白细胞增生,髓鞘增生,9
RARS1,SER456LEU
Nafisinia等在一名由土耳其的堂兄表亲父母出生的男性,患有低髓鞘性白细胞营养不良9(HLD9; 616140)(2017)确定了RARS基因中2个突变的化合物杂合度:c.1367C-T过渡(c.1367C-T,NM_002887.3),导致ser456-leu(S456L)取代,以及2- bp删除(c.1846_1847delTA; 107820.0007),从而导致移码(Tyr61LeufsTer6)和过早的终止密码子。对父母的测试表明,母亲的c.1376C-T突变是杂合的,而父亲的变异是阴性的,这表明患者的删除是从头事件或非父系的结果。该患者属于45例患有低髓鞘性疾病且无分子诊断的患者的一部分,他们接受了RARS基因突变的筛查。

.0007白细胞增生,髓鞘增生,9
RARS1,2-BP DEL,1846TA
为了讨论RARS基因中2 bp缺失(c.1846_1847delTA,NM_002887.3)导致移码(Tyr616LeufsTer6)的现象,该现象在患有低髓鞘性白细胞营养不良9(HLD9; 616140)的患者中以复合杂合状态存在由Nafisinia等(2017),请参阅107820.0006。