高密度脂蛋白胆固醇水平QTL 9;磷脂转移蛋白
人血浆包含至少两种不同的脂质转移蛋白:胆固醇酯转移蛋白(118470),也称为脂质转移蛋白I;和磷脂转移蛋白(PLTP),也称为脂质转移蛋白II。Day等(1994)从人血浆中纯化的表观分子量为81kD的磷脂转移蛋白。他们从NH2末端的氨基酸序列设计了用于聚合酶链反应的引物,并从人内皮cDNA文库中分离出全长cDNA。该cDNA长1,750 bp,包含一个1,518个核苷酸的开放解读码组,编码17个氨基酸的前导序列和476个残基的成熟蛋白。
细胞遗传学位置:20q13.12
基因座标(GRCh38):20:45,898,619-45,912,154
Location | Phenotype | Phenotype MIM number |
Inheritance | Phenotype mapping key |
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20q13.12 | [High density lipoprotein cholesterol level QTL 9] | 3 |
▼ 基因功能
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Tu等(1995)确定了PLTP基因的功能启动子。该启动子由一个TATA框,一个高GC含量区域和几个潜在结合转录因子的共有序列组成。相对于第一个转录起始位点,在-230和-72之间最小的159 bp启动子负责全部活性。两个转录因子结合基序SP1和AP-2位于该区域内。似乎PLTP启动子活性主要依赖于功能区域中的假定的顺式元件。
▼ 测绘
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使用人/啮齿动物体细胞杂交作图面板,Day等(1994)将PLTP基因定位于20号染色体(1995)通过荧光原位杂交将分配范围缩小到20q12-q13.1。LeBoeuf等(1996)证明Pltp基因映射对老鼠染色体2的末端部分。
▼ 分子遗传学
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在对多种高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平反映多种常见DNA序列变体的累积贡献的假设进行评估时,Spirin等人(英文)(2007)确定了PLTP基因(172425.0001)的单核苷酸多态性(SNP)与CETP(118470.0005)和LPL(118470.0042)基因中的其他SNP协同作用,以影响血浆中高密度脂蛋白胆固醇的水平。
Teslovich等人在对超过100,000个欧洲血统的个体的血浆脂质浓度进行的荟萃分析中(2010年)鉴定到PLTP基因附近的rs6065906对HDL胆固醇浓度以及甘油三酸酯具有影响,其影响大小为-0.93 mg / dL,P值为2 x 10(-22)。
▼ 动物模型
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使用胚胎干细胞中的同源重组,江等(1999)生产了没有PLTP基因表达的老鼠。血浆PLTP活性降低导致高密度脂蛋白(HDL)脂质和载脂蛋白显着降低,这表明富含甘油三酸酯的脂蛋白转移表面成分在维持HDL水平方面的重要性。高脂饮食在PLTP-/-小鼠中积累的水泡脂蛋白可能影响动脉粥样硬化的发展。
▼ 等位基因变异体(1个选定的示例):
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.0001高密度脂蛋白胆固醇水平定量性状位点9
PLTP,CT
在一项关于达拉斯心脏研究的参与者以及来自伊利诺伊州梅伍德市的849名非裔美国人的7种HDL代谢基因的关联研究中,Spirin等人(2007年)确定了PLTP基因rs3843763的SNP 与3个孤立样本中HDL胆固醇水平的增量变化有关。在包括种族,性别,年龄和体重指数(BMI)的模型中,在分析整个样本的协方差时,该SNP的P值为1.19 x 10(-4)。较小的等位基因T与HDL胆固醇降低有关。