激活转录因子 7 相互作用蛋白; ATF7IP

ATF7 相互作用蛋白
ATFA 调制器,小鼠,同系物;AM
含有 MBD1 的染色质相关因子; MCAF
MCAF1

HGNC 批准的基因符号:ATF7IP

细胞遗传学位置:12p13.1 基因组坐标(GRCh38):12:14,365,682-14,502,930(来自 NCBI)

▼ 说明

ATF7IP 是一种与异染色质相关的多功能核蛋白。它可以充当转录共激活子或辅阻遏物,具体取决于其结合伙伴(Liu 等人的总结,2009)。

▼ 克隆与表达

德·格雷夫等人(2000) 克隆了小鼠 Atf7ip,他们将其命名为 Am。小鼠Am蛋白含有1,306个氨基酸,计算分子量为138.5 kD。小鼠 Am 的酸性残基主要集中在其 N 端半部,ser 和 thr 残基的总体含量升高,2 个大的富含 pro 的结构域被无 pro 的延伸区隔开,一个推定的二分核定位信号(NLS) 和一个假定的 ATP 结合位点。 Am 直向同源物存在于果蝇、秀丽隐杆线虫、斑马鱼、小鼠、大鼠和人类中。原位杂交揭示了小鼠胚胎发生各个阶段普遍存在的 Am 表达。在成年小鼠中,在胃、脑、舌头、肠、子宫、淋巴、脾和睾丸中检测到 Am 表达。免疫荧光分析显示,小鼠 Am 蛋白被限制在小鼠 P19 细胞的细胞核的核质中,这种定位是由 Am NLS 介导的。

Wang 等人使用质谱法鉴定与 SETDB1(604396) 共纯化的 HeLa 细胞蛋白,然后进行 EST 数据库和基因组序列分析(2003) 克隆了全长 ATF7IP,他们称之为 AM。推导的 1,270 个氨基酸的人类蛋白与小鼠 Am(一种 Atfa(ATF7;606371) 相关因子)具有 78% 的同一性。通过 SDS-PAGE 检测,人 AM 的表观分子质量为 200 kD。

Fujita 等人在 HeLa 细胞 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中使用 MBD1(156535) 的转录阻遏结构域作为诱饵(2003) 克隆了 ATF7IP,他们称之为 MCAF。推导的 1,270 个氨基酸的蛋白质在其 C 端一半包含 2 个保守结构域。蛋白质印迹分析在几种人类细胞系中检测到表观分子质量约为 200 kD 的内源性 MCAF。 MCAF 和 MBD1 共定位于 HeLa 细胞间期细胞核的多个病灶中。

内村等人(2006) 在人 MCAF1 的 2 个 C 末端结构域之间鉴定了一个高度保守的 SUMO(参见 SUMO1;601912)相互作用基序。

▼ 基因功能

De Graeve 等人使用重组蛋白(2000)表明小鼠Am蛋白具有ATP酶活性。 Am 在小鼠 P19 细胞的细胞核中与 Atfa 相互作用并共定位,充当转录抑制因子。 Pull-down 测定显示 Am 与 Tfiie(参见 189962)和 Tfiih(参见 189972)一般转录因子和 RNA 聚合酶的几个亚基相互作用。

王等人(2003) 表明重组小鼠 Am 增加了重组小鼠 Setdb1 针对组蛋白 H3(参见 602810)lys9(H3K9) 的甲基转移酶活性。重组Am-Setdb1复合物的甲基转移酶活性与从HeLa细胞纯化的内源AM-SETDB1复合物相当。 Am 通过增加 Vmax 和减少 Km 来增加反应的周转率。在不存在Am的情况下,主要的Setdb1产物是二甲基化的H3K9,而在存在Am的情况下,主要的Setdb1产物是三甲基化的H3K9。这些结果通过 HEK293 细胞和 HeLa 细胞中小干扰 RNA 介导的 AM 敲低得到证实。使用重建的染色质转录系统表明 Am 还增强了 Setdb1 的转录抑制活性。

Fujita 等人使用相互免疫沉淀分析和蛋白质下拉分析(2003) 证实了 MCAF 和 MBD1 之间的直接相互作用。删除分析显示,MBD1 的 C 端转录抑制结构域(TRD) 与 MCAF 的 C 端最保守结构域相互作用。报告基因检测表明,MCAF 增强了 SP1(189906) 介导的多个 SP1 响应启动子的转录。然而,MCAF 还增加了 MBD1 的孤立 TRD 对 SP1 的抑制功能。染色质免疫沉淀分析显示 MBD1 将 MCAF 连接到甲基化启动子。无论 MBD1 是否存在,MCAF 也与未甲基化的启动子相关。

一村等人(2005) 表明 MCAF1 和 MCAF2(ATF7IP2; 613645) 均与 MBD1 的 C 端 TRD 以及 SETDB1 和 SP1 结合。对 K562 人红白血病细胞的免疫沉淀分析显示,MCAF1 对 SETDB1 的亲和力高于 SP1,而 MCAF2 对 SP1 的亲和力高于 SETDB1。在相同的免疫沉淀物中也检测到了两种 MCAF 蛋白。 MCAF1 和 MCAF2 都会增加 SP1 激活的报告基因的转录,并且在 MCAF1 或 MCAF2 存在的情况下,MBD1 的 TRD 会适度抑制转录。 MCAF1、MBD1 的 TRD 和 SETDB1 的组合以 SETDB1 依赖性方式引起显着的转录抑制。相反,在 MCAF2 和 MBD1 的 TRD 存在的情况下,SETDB1 对启动子活性没有影响。 HeLa 细胞中 MCAF1 的敲低消除了 MBD1 TRD 的抑制,MCAF2 的外源表达部分补偿了 MCAF1 的敲低。

内村等人(2006)发现MBD1在HeLa细胞中被多重SUMO化,并且MBD1的SUMO化增加了其与MCAF1的相互作用。 MCAF1 本身不是苏酰化的目标。 MCAF1 和内源性 SUMO1 或 SUMO2(603042)/SUMO3(602231) 部分共定位于 C-33A 人宫颈癌细胞的核灶。 SUMO1 或 SUMO2/SUMO3 的敲低破坏了 MCAF1 与 MBD1 的关联。 SUMO 敲低还破坏了 MBD1 与异染色质组装所需的几个因子的关联,包括 HP1-β(CBX1; 604511)。 MCAF1 SUMO 结合片段的异位表达导致 MCAF1 和 HP1-β 离域,可能是通过游离 SUMO 蛋白的隔离所致。

Liu 等人使用蛋白质下拉分析和缺失分析(2009) 发现 MCAF1 的 2 个保守结构域直接与 SP1 中重叠的 C 端结构域相互作用。 HeLa 细胞的染色质免疫沉淀分析显示 MCAF1 和 SP1 均与 TERT(187270) 和 TERC(602322) 启动子区域相关。小干扰 RNA 介导的敲低研究表明 MCAF1 以 SP1 依赖性方式与 TERT 启动子相互作用。 MCAF1 或 SP1 的敲低通过减少磷酸化 RNA 聚合酶 II(参见 180660)和 ERCC3(133510)在 TERT 启动子处的关联来下调 TERT 的表达,并损害端粒维持。免疫沉淀分析显示,MCAF1 与 TFIIE-α(GTF2E1; 189962)、TFIIE-β(GTF2E2; 189964)、ERCC2(126340) 和 ERCC3 一起包含在通用转录复合物中。蛋白质下拉分析和结构域分析表明,这些蛋白质中的每一种都结合 MCAF1 的 1 个或两个保守结构域。

▼ 测绘

Hartz(2010) 根据 ATF7IP 基因(GenBank AK001550) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ATF7IP 基因定位到染色体 12p13.1。