STING1 ER 退出蛋白 1; STEEP1

染色体 X 开放解读码组 56; CXORF56

HGNC 批准的基因符号:STEEP1

细胞遗传学位置:Xq24 基因组坐标(GRCh38):X:119,538,149-119,565,409(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

沃克等人(2018) 报道人类 CXORF56 产生 4 个转录本。三个转录本编码相同的 222 个氨基酸蛋白质,另一个转录本编码 173 个氨基酸蛋白质。 CXORF56 在物种间高度保守。免疫组织化学分析显示,内源性 CXorf56 蛋白主要在小鼠大脑皮层和小脑神经元的细胞核和细胞体中表达。人类 CXORF56 蛋白在非神经元 HEK293T 细胞中的过度表达显示主要定位于核,排除核仁。人类 CXORF56 蛋白在培养的小鼠原代海马神经元中的过度表达揭示了其定位于细胞核、树突和突触后树突棘。

▼ 基因结构

沃克等人(2018)报道CXORF56基因包含7个外显子。

▼ 测绘

沃克等人(2018) 报道 CXORF56 对应到染色体 Xq24。无内含子 CXORF56 假基因位于染色体 8p11.23 上。

▼ 分子遗传学

Verkerk 等人在来自一个患有 X 连锁智力发育障碍 107(XLID107; 301013) 的荷兰多​​代大家庭的 5 名受影响男性和 1 名受影响女性中(2018) 在 CXORF56 基因(301012.0001) 中发现了半合子或杂合移码突变。该突变是通过连锁分析和全基因组测序相结合发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。 X染色体失活研究表明,女性携带者的变异等位基因有偏向失活(76-93%),而受影响的女性则没有偏向X染色体失活模式,这表明她的突变mRNA水平高于其他女性在未受影响的女性中。对患者细胞的分析表明,与对照组相比,无义介导的 mRNA 衰减和突变 mRNA 水平降低。研究结果表明存在功能丧失效应。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):

.0001 智力发育障碍,X 连锁 107(1 个家庭)
STEEP1、2-BP INS、159TA

Verkerk 等人在来自一个患有 X 连锁智力发育障碍 107(XLID107; 301013) 的荷兰多​​代大家庭的 5 名受影响男性和 1 名受影响女性中(2018) 在 CXORF56 基因的外显子 2 中发现了半合或杂合 2 bp 插入(c.159_160insTA, NM_022101.3),预计会导致移码和提前终止(Asp54Ter)。该突变是通过连锁分析和全基因组测序相结合发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。在 1000 个基因组计划、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库或 188 个荷兰对照中未发现该突变。家里有8名未受影响的女性携带者。 X染色体失活研究表明,女性携带者的变异等位基因有偏向失活(76-93%),而受影响的女性则没有偏向X染色体失活模式,这表明她的突变mRNA水平高于其他女性在未受影响的女性中。对患者细胞的分析表明,与对照组相比,无义介导的 mRNA 衰减和突变 mRNA 水平降低。研究结果表明存在功能丧失效应。