WNT 信号通路 1 的 NKD 抑制剂; NKD1
裸角质层,果蝇,同源物,1
HGNC 批准的基因符号:NKD1
细胞遗传学位置:16q12.1 基因组坐标(GRCh38):16:50,548,396-50,649,249(来自 NCBI)
▼ 说明
在小鼠中,Nkd 是一种 Disheveled(参见 DVL1;601365)结合蛋白,充当 Wnt(参见 WNT1;164820)-β-连环蛋白(参见 116806)-Tcf(参见 602272)信号通路的负调节因子。
▼ 克隆与表达
Katoh(2001) 通过数据库搜索小鼠 Nkd 的同源物,然后对胎儿组织的 mRNA 混合物进行 PCR,克隆了 NKD1。推导的 470 个氨基酸的蛋白质包含 EF-hand Ca(2+) 结合基序。 NKD1 与 NKD2(607852) 总体同一性约为 44%,其中 4 个主要同源域(包括 EF-hand 基序)的同一性超过 75%。 Northern 印迹分析揭示了 5 个 9.3 至 2.3 kb 转录物在成人和胎儿组织以及癌细胞系中的广泛表达。在胎儿肾脏中检测到最高表达,其次是胎儿肺、胎盘和成人肝脏、肾脏、胰腺和脾脏。通过使用替代的聚腺苷酸化位点生成多个转录本。
沃顿商学院等人(2001) 克隆了小鼠 Nkd1 并鉴定了含有人 NKD1 的 EST。小鼠和人类 NKD1 均具有中央 EF 手基序和富含组氨酸的 C 末端,该末端被保守的谷氨酸残基中断。 NKD1 还具有假定的 N 末端肉豆蔻酰化位点。小鼠和人类 NKD1 有 86% 的同一性。
▼ 基因功能
沃顿商学院等人(2001) 确定小鼠 Nkd1 的 EF-hand 和侧翼序列与果蝇和小鼠 Dvl 的基本/PDZ 结构域在酵母 2-杂交测定中相互作用。在小鼠发育过程中,Nkd1 和 Nkd2 在多个组织中以部分重叠的梯度模式表达,其中一些与已知的 Wnt 活性模式相关。在共转染的 COS-7 和 HEK293 细胞中,小鼠 Nkd1 阻断 Wnt1 介导的 Wnt 依赖性报告构建体的激活,但不能阻断 β-catenin 介导的激活。果蝇中小鼠 Nkd1 的错误表达会拮抗 Wnt1 功能。
▼ 基因结构
Katoh(2001)确定NKD1基因包含10个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,沃顿商学院等人(2001) 将 NKD1 基因定位到染色体 16q12。