Teneurin 跨膜蛋白 3; TENM3
ODZ,果蝇,同源物,3; ODZ3
腱蛋白M3; TNM3
KIAA1455
HGNC 批准的基因符号:TENM3
细胞遗传学位置:4q34.3-q35.1 基因组坐标(GRCh38):4:181,447,613-182,803,024(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000)克隆了 ODZ3 的部分 cDNA,他们将其命名为 KIAA1455。推导的蛋白质与小鼠 Doc4(TENM4; 610084) 超过 1,769 个氨基酸具有 69% 的氨基酸同一性。 RT-PCR ELISA 检测到成人和胎儿脑中 ODZ3 表达较高,睾丸和卵巢中表达水平略低,所有其他外周组织中表达水平中等。在所检查的所有特定大脑区域中表达均较高,其中杏仁核和尾状核中表达水平最高,其次是丘脑和底丘脑核。
本-祖尔等人(2000) 克隆小鼠 Odz3。预测的 2,705 个氨基酸蛋白包含一个推定的 N 端信号肽,随后是 8 个连续的 EGF(131530) 样重复序列、一个跨膜结构域以及与其他 ODZ 蛋白同源的 1,800 个氨基酸序列。 Northern 印迹分析检测到 Odz3 在早期小鼠胚胎以及成年大脑和睾丸中表达,但在脾脏或肝脏中未检测到。小鼠胚胎原位杂交显示Odz3主要在神经系统中表达。在神经系统之外,表达主要在一组有限的中胚层衍生组织中观察到。
▼ 基因功能
Boucard 等人使用亲和色谱法和质谱法来鉴定大鼠脑蛋白(2014) 发现固定化大鼠 latrophilin-1(LPHN1 或 ADGRL1;616416)与所有 4 个 tenurin 结合,包括 Tenm3。他们利用 Tenm2(610119) 和 Tenm4 进行进一步研究,发现 tenurins 主要结合 Lphn1 的凝集素结构域。在凝集素结构域附近含有共有序列 KVEQK 的 Lphn1 同工型显示出比不含该序列的 Lphn1 同工型更低的 teneurin 结合亲和力。表达大鼠 Lphn1、Lphn2(ADGRL2;607018) 或 Lphn3(ADGRL3;616417) 的 HEK293 细胞不会聚集。同样,表达 Tenm2 或 Tenm4 的细胞也不会聚集。然而,将表达懒虫蛋白的细胞与表达细纤维蛋白的细胞混合会产生表明细胞间粘附的大细胞聚集体。 teneurin-latrophilin 相互作用的发生与钙无关。布卡德等人(2014) 得出结论,teneurins 和 latrophilins 形成经典的异嗜性细胞粘附对,并且 latrophilins 中的选择性剪接调节相互作用。
伯恩斯等人(2018) 表明,小鼠 teneurin-3 在海马区的多个拓扑互连区域中表达,包括近端 CA1、远端下托和内侧内嗅皮层。病毒遗传分析表明,CA1 和下托神经元都需要 teneurin-3,以将近端 CA1 轴突精确定位到远端下托。此外,teneurin-3 以剪接异构体依赖性方式促进体外同源粘附。伯恩斯等人(2018) 得出的结论是,他们的研究结果证明了多个海马区域存在显着的遗传异质性,并表明 tenurin-3 可能通过匹配表达和同质吸引来协调哺乳动物大脑中复杂分布式电路的组装。
▼ 测绘
通过辐射杂交分析,Nagase 等人(2000) 将 TENM3 基因定位到 4 号染色体。
Gross(2015) 根据 TENM3 序列(GenBank AB040888) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TENM3 基因对应到染色体 4q35.1。
▼ 分子遗传学
孤立性小眼症伴缺损 9
Aldahmesh 等人在沙特阿拉伯的一对患有非综合征性双侧缺损性小眼症(MCOPCB9; 615145) 的兄弟姐妹中,他们的已知小眼症基因突变呈阴性(2012) 鉴定了 ODZ3 基因(610083.0001) 中 1 bp 插入的纯合性。
综合征性小眼症 15
Chassaing 等人在一名患有双侧缺损性小眼畸形和发育迟缓的 9 岁男孩中(MCOPS15;参见 615145)(2016) 鉴定了 TENM3 基因(610083.0002) 中剪接位点突变的纯合性。
Stephen 等人在 2 名患有眼部缺损和小角膜以及发育迟缓的姐妹中(2018) 鉴定了 TENM3 基因(C619X; 610083.0003) 中的无义突变的纯合性,该突变与家族中的疾病分离。
Singh 等人在一名患有小眼症、巩膜角膜、眼前节发育不全和严重发育迟缓的 9 岁印度男孩中(2019) 鉴定了 TENM3 基因中 2 个错义突变的复合杂合性(A1349G,610083.0004 和 R2563W,610083.0005)。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 孤立性小眼炎,伴有 COLOBOMA 9(1 个家族)
TENM3,1-BP DUP,2083A
Aldahmesh 等人发现,沙特阿拉伯的一对兄弟姐妹患有非综合征性双侧缺损性小眼畸形(MCOPCB9; 615145),由第三代表亲父母所生(2012) 鉴定了 ODZ3 基因外显子 12 中 1 bp 插入(2083dupA) 的纯合性,导致预计会导致提前终止的移码(Thr695AsnfsTer5)。实时 PCR 和定量 RT-PCR 显示所得转录物完全消失,很可能是无义介导的衰变的结果。未受影响的父母为杂合突变,在 160 个沙特外显子组、192 个沙特对照染色体或外显子组变异服务器中的 10,017 个染色体中未发现该突变。
.0002 小眼症,综合症 15
TENM3、IVS16AS、A-T、-2
Chassaing 等人在一名患有双侧缺损性小眼畸形和发育迟缓的 9 岁男孩中(MCOPS15;参见 615145)(2016) 鉴定了 TENM3 基因内含子 16 中剪接位点突变(c.2968-2A-T, NM_001080477) 的纯合性。他未受影响的表亲父母和未受影响的姐妹是该突变的杂合子,在外显子组变异服务器或 ExAC 数据库中未发现该突变。 RT-PCR 分析表明,该突变导致外显子 17 跳跃,预测移码并引入过早终止密码子(Val990CysfsTer13)。
.0003 小眼症,综合症 15
TENM3、CYS619TER
Stephen 等人在 2 名患有眼部缺损和小角膜以及发育迟缓的姐妹中(MCOPS15;参见 615145)(2018) 鉴定了 TENM3 基因中 c.1857T-A 颠换(c.1857T-A, NM_001080477.3) 的纯合性,导致 cys619 到 ter(C619X) 取代。他们未受影响的父母是突变杂合子。据报道,一位舅舅患有严重的视力丧失和小眼睛。患者细胞无法用于研究。
.0004 小眼症,综合症 15
TENM3、ALA1349GLY
Singh 等人在一名患有小眼症、巩膜角膜、眼前节发育不全和严重发育迟缓的 9 岁印度男孩中(MCOPS15;参见 615145)(2019) 鉴定了 TENM3 基因中 2 个错义突变的复合杂合性:外显子 22 中的 c.4046C-G 颠换(c.4046C-G,NM_001080477.3),导致 ala1349 到甘氨酸(A1349G)的取代,以及外显子 28 中的 c.7687C-T 转变,导致 arg2563 至 trp(R2563W;610083.0005) 取代。两种突变都发生在高度保守的残基处。千人基因组计划或 ExAC 数据库中均未发现这两种变体;在 gnomAD 数据库中未发现 A1349G,而 R2563W 变体存在于 8,718 名非洲裔个体中的 1 名中。先证者未受影响的父亲和兄弟均为 A1349G 突变杂合子;然而,他未受影响的母亲并不携带另一种变异,这表明母亲存在嵌合体,或者先证者是从头发生的。
.0005 小眼症,综合症 15
TENM3、ARG2563TRP
讨论 TENM3 基因外显子 28 中的 c.7687C-T 转换(c.7687C-T,NM_001080477.3),导致 arg2563 至 trp(R2563W) 取代,该取代在复合杂合状态中发现Singh 等人研究了一名 9 岁印度男孩,患有小眼症、巩膜角膜、眼前节发育不全和严重发育迟缓(MCOPS15;参见 615145)(2019),参见 610083.0004。