TLX1 邻居; TLX1NB
TLX1 趋异基因; TD1
HGNC 批准的基因符号:TLX1NB
细胞遗传学位置:10q24.31 基因组坐标(GRCh38):10:101,089,321-101,141,266(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Greene 等人通过寻找 10 号染色体上 TLX1 基因(186770) 上游的基因,(2007) 鉴定了 TD1 基因,该基因的转录方向与 TLX1 相反。推导的 122 个氨基酸的 TD1 蛋白的计算分子量为 13.4 kD。它富含脯氨酸,并具有 8 个潜在的丝氨酸/苏氨酸磷酸化位点和 C 端亮氨酸拉链样区域,具有预测的两亲性 α 螺旋结构。 TD1 被预测为核蛋白。数据库分析显示,TD1 编码区仅在灵长类动物中保守,尽管部分上游区域在其他几种哺乳动物物种中也是保守的。对白血病细胞系的 RT-PCR 分析检测到 TD1 主要在表达 TLX1 的细胞系中表达。
▼ 基因结构
格林等人(2007) 确定 TD1 基因包含 3 个外显子,跨度约为 42 kb。前 2 个外显子是非编码的。 5-prime UTR 包含 14 个上游起始密码子和 11 个长度大于 10 个氨基酸的上游 ORF。 TD1 和 TLX1 之间的 161 bp 基因间区域在小鼠和人类之间高度保守,包含许多 GC 框和嵌入 CpG 岛内的位于中心的 CCAAT 框。它没有明显的 TATA 框子。报告基因检测表明,基因间区域对于 TD1 和 TLX1 的表达具有强大的双向启动子活性。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Greene 等人(2007) 将 TD1 基因定位到染色体 10q24。它以头对头的方向位于 TLX1 基因的上游。