蛋白酶体 26S 亚基,非 ATP 酶,1; PSMD1
p112
HGNC 批准的基因符号:PSMD1
细胞遗传学位置:2q37.1 基因组坐标(GRCh38):2:231,056,867-231,172,827(来自 NCBI)
▼ 说明
Th 26S 蛋白酶体是一种主要的 ATP 依赖性细胞内蛋白酶,参与细胞蛋白质的分解,包括参与细胞周期进程和代谢调节的蛋白质、错误折叠或未折叠的蛋白质以及标记为降解的泛素化蛋白质。蛋白酶体泛素化系统还负责抗原肽的产生。 PSMD1 是 26S 蛋白酶体的一个大调节亚基(Yokota 等人,1996 年总结)。
▼ 克隆与表达
Yokota 等人使用基于大鼠肝脏 p112 cDNA 的探针(1996) 从 HepC2 肝母细胞瘤 cDNA 文库中克隆了人类 PSMD1 的 2 个剪接变体,他们将其称为 p112。较大的 cDNA p112L 编码推导的 953 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 105.9 kD。 p112S 变体编码推导的 817 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 90.5 kD,与 p112L 相比,其 N 末端被截短。两种亚型均含有 2 个富含赖氨酸和谷氨酸(KEKE 基序)的 C 末端区域。 Northern 印迹分析检测到约 3.5 kb 转录物在人体组织中普遍表达,其中在心脏和骨骼肌中表达最高。 PCR 分析在人肾癌 KPK13 细胞和正常成人肾脏中检测到 p112 转录本,其中以 p112S 为主。在牛和大鼠中鉴定出了 p112 的密切直系同源物,p112 与酿酒酵母 Sen3 具有 42% 的氨基酸同一性,Sen3 是一种 26S 蛋白酶体调节亚基,也调节 tRNA 剪接核酸内切酶。
▼ 基因功能
横田等人(1996)发现酵母Sen3的敲除并没有改变酵母在基础条件下的生长,但它抑制了高温下的生长,在泛素途径介导的蛋白水解、N端规则系统、镉胁迫反应中存在缺陷暴露以及核蛋白转移。人类p112L(而非p112S)的过表达抑制了Sen3敲除酵母在高温下的生长缺陷。
Ryu 等人使用非洲爪蟾卵提取物(2014) 发现 Psmd1 与 Adrm1(610650) 相互作用,Adrm1 是一种蛋白酶体亚基,可招募泛素化蛋白进行蛋白水解。 Piasy(PIAS1; 603566) 依赖性地将 Sumo2(603042) 或 Sumo3(602231) 共价添加到 Psmd1 C 末端区域的赖氨酸上,干扰 Psmd1-Adrm1 相互作用。相反,Senp1(612157) 对 Psmd1 的去苏酰化恢复了 Psmd1-Adrm1 相互作用。柳等人(2014) 得出结论,PSMD1 的 sumoylation 可能会改变蛋白酶体的组成和功能,以调节泛素介导的蛋白质降解。
▼ 测绘
通过 FISH,Yokota 等人(1996) 将 PSMD1 基因定位到染色体 2q37.1-q37.2。
Hartz(2018) 根据 PSMD1 序列(GenBank D44466) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PSMD1 基因对应到染色体 2q37.1。