CCR4-非转录复合物，亚基 2； CNOT2

转录负调控子 2，酿酒酵母，同源物；NOT2

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HGNC 批准的基因符号：CNOT2

细胞遗传学位置：12q15 基因组坐标（GRCh38）：12:70,243,018-70,354,993（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

酵母 CCR4-NOT 蛋白复合物是 RNA 聚合酶 II 转录的全局调节因子。它部分由 CCR4（参见 608951）、NOT1 至 NOT5 和 CAF1（也称为 POP2）组成。通过搜索序列数据库，Albert 等人（2000）鉴定了编码酵母 NOT1、NOT2、NOT3、NOT4 和 CAF1 同源物的人类 EST。他们组装了包含全长编码序列的人类 NOT2 cDNA。推导的 540 个氨基酸的人 NOT2 蛋白与 191 个氨基酸的酵母 NOT2 蛋白具有 26% 的整体序列同一性。与酵母 NOT2 相比，人 NOT2 具有 N 末端延伸。人类 NOT2 包含 N 端假定的二分核定位信号。 Albert 等人使用酵母 2-杂交测定法（2000）证明重组人 NOT2 可以与酵母 NOT1 和 N 末端截短的人 NOT1 蛋白相互作用（604917）；它与人 NOT3（604910）或酵母 CCR4 没有显着相互作用。 Northern印迹分析在所有检查的人体组织中检测到3.2-kb NOT2转录物，即脑、心脏、肺、肝、肾、小肠、结肠、脾、胸腺、外周血白细胞、骨骼肌和胎盘。与人类 NOT1、NOT3 和 CALIF（603731）的表达一样，NOT2 表达在大脑、肾脏和胎盘中很高，而在骨骼肌和结肠中表达很低。阿尔伯特等人（2000）发现重组人 NOT2 不能补充酵母 not2-1 突变所赋予的温度敏感表型。

▼ 基因结构

上原等人（2019）指出CNOT2基因包含21个外显子。

▼ 测绘

阿莱西等人（2017）指出 CNOT2 基因对应到染色体 15q15。

▼ 基因功能

塞申斯等人（2009）通过使用成熟的 22,632 双链 RNA 文库在黑腹果蝇细胞中进行全基因组 RNA 干扰筛选，确定了登革热病毒（参见 614371）遗传所需的昆虫宿主因子。该筛选确定了 116 种候选登革热病毒宿主因子（DVHF）。尽管其中一些先前与黄病毒有关，但大多数 DVHF 最近与登革热病毒遗传有关。双翅目 DVHF 具有 82 个易于识别的人类同源物，并且使用靶向短干扰 RNA 筛选，他们显示其中 42 个是人类 DVHF。其中包括 NPR2（108961）、SEC61B（609214）、TMEM214、TAZ（300394）、EXDL2 和 CNOT2。塞申斯等人（2009）的结论是，这种重叠表明双翅目和人类宿主之间所需因子的显着保守。

▼ 分子遗传学

在一名 13 岁男孩中，患有智力发育障碍，伴有鼻音、面容畸形和多种骨骼异常（IDNADFS; 618608），Alesi 等人（2019）在 CNOT2 基因（604909.0001）内发现了一个从头杂合的 85-kb 基因内缺失。通过染色体微阵列分析发现了缺失。对 ExAC 数据库的检查表明 CNOT2 基因中的功能丧失变异是不能容忍的。尽管没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，Alesi 等人（2019）表明 CNOT2 的单倍体不足是造成表型的原因。

Uehara 等人在一名患有 IDNADFS 的 6 岁日本男孩中进行了研究（2019）鉴定了 CNOT2 基因中的从头杂合无义突变（K316X; 604909.0002）。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的，在 ExAC 数据库或 2,048 名日本对照个体中均未发现。尚未进行该变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变体会导致无义介导的 mRNA 衰减和单倍体不足。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 智力发育障碍，伴有鼻音、面部畸形和骨骼异常
CNOT2，85 KB DEL

在一名 13 岁男孩中，患有智力发育障碍，伴有鼻音、面容畸形和多种骨骼异常（IDNADFS; 618608），Alesi 等人（2019）鉴定了 CNOT2 基因内涉及外显子 3 至外显子 15 的从头杂合 85-kb 基因内缺失（chr12.70,672,317-70,757,341,GRCh37）。通过染色体微阵列分析发现了缺失。对 ExAC 数据库的检查表明 CNOT2 基因中的功能丧失变异是不能容忍的。尽管没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，Alesi 等人（2019）表明 CNOT2 的单倍体不足是造成表型的原因。

.0002 智力发育障碍，伴有鼻音、面部畸形和骨骼异常
CNOT2、LYS316TER

在一名 6 岁日本男孩中，他患有智力发育障碍，伴有鼻音、面容畸形和多种骨骼异常（IDNADFS；618608），Uehara 等人（2019）在 CNOT2 基因的外显子 11 中鉴定出从头杂合的 c.946A-T 颠换（c.946A-T, NM_001199302.1），导致 lys316 到 ter（K316X）的取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的，在 ExAC 数据库或 2,048 名日本对照个体中均未发现。尚未进行该变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变体会导致无义介导的 mRNA 衰减和单倍体不足。