KXDL 含有基序的蛋白质 1; KXD1
19 号染色体开放解读码组 50; C19ORF50
HGNC 批准的基因符号:KXD1
细胞遗传学位置:19p13.11 基因组坐标(GRCh38):19:18,557,870-18,569,378(来自 NCBI)
▼ 说明
根据小鼠和果蝇实验,KXD1 预计在溶酶体相关细胞器的生物发生中发挥作用(Yang et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析,Yang 等人(2012) 鉴定了人类 KXD1 和小鼠 Kxd1 的 2 个剪接变体,他们将其命名为 Kxd1a 和 Kxd1b。推导的小鼠 Kxd1a 蛋白由 177 个氨基酸组成,计算分子量为 20 kD,与人 KXD1 具有 93% 的氨基酸一致性。 Kxd1a 预计有 2 个卷曲螺旋区域,其中第二个区域包含 KxDL 基序。与 Kxd1a 相比,Kxd1b 编码一个由 219 个氨基酸组成的推导蛋白,具有 N 末端延伸。蛋白质印迹分析检测到单个 Kxdl1 蛋白在所有检查的小鼠组织中以不同水平表达。
▼ 基因功能
使用蛋白质相互作用测定,Yang 等人(2012) 表明小鼠 Kxd1 与 BLOS1(BLOC1S1; 601444) 以及所检测的溶酶体相关细胞器复合体 1(BLOC1) 生物发生的所有其他亚基相互作用。通过小干扰 RNA 敲低 HeLa 细胞中的 BLOS1 会降低 KXD1 蛋白含量。
浦等人(2015) 确定 BLOC1S1、BLOC1S2(609768)、Snapin(607007) 以及可能的 KXD1 是 2 个蛋白质复合物(BLOC1 和 BLOC1 相关复合物(BORC))的亚基。 BORC 招募了小 GTP 酶 ARL8B(616596) 并介导溶酶体的驱动蛋白依赖性运动沿着微管的正端向细胞外围移动。干扰 BORC 或该途径的其他成分会导致溶酶体塌陷到中心粒周围区域,并减少细胞扩散和细胞迁移。
▼ 测绘
Hartz(2013) 根据 KXD1 序列(GenBank AK098346) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 KXD1 基因对应到染色体 19p13.11。
▼ 动物模型
杨等人(2012) 发现 Kxd1 -/- 小鼠具有轻度表型,包括血小板中致密颗粒含量减少和视网膜色素上皮中黑素体畸形。视网膜缺陷与真黑色素含量显着减少有关。 Kxd1 的敲除降低了 Blos1 的稳态水平,而 BLOC1 亚基 Dysbindin(DTNBP1; 607145) 和 Pallidin(BLOC1S6; 604310) 的水平不受影响。同样,BLOC1 小鼠突变体桑迪(DTNBP1)、突变(BLOC1S5; 607289) 和苍白(BLOC1S6) 中的 Kxd1 含量也没有改变。