P-体结合的负调节子; NBDY

长基因间非编码 RNA 1420; LINC01420
未注释的 P-体解离多肽;NOBODY

HGNC 批准的基因符号:NBDY

细胞遗传学位置:Xp11.21 基因组坐标(GRCh38):X:56,729,243-56,819,179(来自 NCBI)

▼ 说明

mRNA 在 5-prime-to-3-prime 方向上的降解需要去除 5-prime cap 复合物。 NBDY 是一种小多肽,定位于称为 mRNA 加工体或 P 体的 mRNA 衰变颗粒。在那里,NBDY 与 5-prime mRNA 脱帽蛋白相互作用并下调 P-body 数量,抑制 mRNA 降解(D'Lima et al., 2017)。

▼ 克隆与表达

通过在人类数据库中搜索小 ORF,D'Lima 等人(2017) 确定了 NBDY,他们称之为 NoBody。推导的 68 个氨基酸肽的预测分子量为 7 kD。定量 RNA 测序显示,在所有检查的 11 个人体组织中,NoBody 表达存在差异,其中肺中表达最高,肝脏中表达最低。表位标记的 NoBody 定位于转染 HEK293T 细胞的细胞质 P 体。数据库分析在小鼠中检测到 NoBody 的直系同源物,但在斑马鱼或果蝇中未检测到。

▼ 基因功能

D'Lima 等人使用半定量蛋白质分析(2017) 发现人类 NoBody 与 mRNA 脱帽和 5-prime-to-3-prime mRNA 衰变复合物的成分相互作用。 EDC4(606030) 是最丰富的 NoBody 相互作用蛋白。免疫共沉淀分析、蛋白质下拉和交联实验证实了 NoBody 与 EDC4 的直接相互作用。通过小干扰 RNA 敲低 HEK293T 细胞中的 EDC4,破坏了 NoBody 与其他脱帽蛋白的相互作用。删除分析显示,NoBody 残基 leu30 和 trp34 是 NoBody 与 EDC4 相互作用所必需的。 NoBody 的过度表达(而非缺乏 NoBody ORF 的宿主 LINC01420 mRNA)导致 P-body 成分的分散,并抑制突变 mRNA 底物的降解。相反,沉默内源性 NoBody 会增加每个细胞的 P 体数量,并加速突变 mRNA 的降解。

▼ 基因结构

达利马等人(2017) 确定 NBDY 基因至少有 3 个外显子,跨度至少 88 kb,并显示出广泛的选择性剪接。外显子 1 包含 NBDY 开放解读码组。

▼ 测绘

达利马等人(2017) 将 NBDY 基因对应到染色体 Xp11.1。小鼠 Nbdy 基因定位于 X 染色体。