PHD 指蛋白 19； PHF19

HGNC 批准的基因符号：PHF19

细胞遗传学位置：9q33.2 基因组坐标（GRCh38）：9:120,855,651-120,904,128（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

王等人（2004） 在永生化成纤维细胞系中第 9 号染色体上的逆转录病毒整合位点附近发现了一个新基因 PHF19。对源自该基因的 cDNA 序列的分析表明，它编码与果蝇“多梳状”同源的蛋白质（PCL） 蛋白质。王等人（2004） 确定，他们将其命名为 PCL3 的人类基因编码 2 种推导的蛋白质：207 个氨基酸的短形式（PCL3S） 和 580 个氨基酸的长形式（PCL3L）。这两种蛋白质的 N 末端有 155 个共同氨基酸。 PCL3L 蛋白与人类 PCL1（PHF1; 602881） 和 PCL2（MTF2; 609882） 蛋白分别具有 41% 和 44% 的序列同一性。 PCL 家族蛋白包含一个 Tudor 结构域、2 个 PHD 指、一个 PCL 同源结构域和一个 C 末端尾部。 PCL3L 还包含 2 个假定的核定位信号。对多个人体组织的 Northern 印迹分析显示，在所有检查的组织中，1.0 和 4.8 kb 的 2 个主要 PCL3 转录物均处于低水平表达，其中在胸腺和心脏中表达最高。 PCL3L 在胎盘、骨骼肌和肾脏中占主导地位，PCL3S 在肝脏和外周血白细胞中占主导地位。免疫荧光显微镜显示 PCL3S 和 PCL3L 在细胞核中具有不同但重叠的定位模式。核周细胞质中可见少量PCL3S。

▼ 基因功能

在报告基因检测中，Wang 等人（2004） 发现当 PCL3S 和 PCL3L 与 GAL4 的结合域融合时，都会抑制转录活性。

Wang 等人使用 cDNA 斑点印迹和 Northern 印迹分析（2004）发现PCL3 mRNA，尤其是PCL3S，在多种癌症中过度表达，包括结肠癌、皮肤癌、肺癌、直肠癌、宫颈癌、子宫癌和肝癌，以及源自黑色素瘤和神经胶质瘤的细胞系。还观察到较高的 PCL3 表达与更晚期的癌症之间存在相关性，这使得作者提出 PCL3 表达的激活与肿瘤进展过程中的单个步骤无关。

潘等人（2015） 发现 G9A（EHMT2; 604599） 表达在人胰腺癌细胞中不受调节，并且 G9A 的上调会增加 E-钙粘蛋白（CDH1; 192090） 启动子上 H3K9 和 H3K27 的甲基化，从而下调其表达。具体来说，G9A 直接与 PCL3 的启动子（多梳抑制复合物 2（PRC2） 的一个组成部分）结合，并增加 PCL3 的表达。通过增加 PCL3 表达，G9A 增加 PRC2 向 E-钙粘蛋白启动子的募集，从而通过抑制 KDM7A 的表达来下调其表达（619640）。生物信息分析和小鼠体内研究支持了这些结果，并表明 G9A 可能协调 PCL3 和 KDM7A 来抑制胰腺癌中的 E-钙粘蛋白。

▼ 基因结构

王等人（2004） 确定 PCL3 基因至少包含 15 个外显子，跨度超过 20 kb 的基因组 DNA。 PCL3S 的转录在外显子 5 末端停止，其中包含潜在的聚腺苷酸化信号；在 PCL3L 中，外显子 5 开头的 101 个核苷酸被剪接至外显子 6，并且该序列继续到外显子 15 的末端。

▼ 测绘

通过序列分析，Wang 等人（2004） 将 PCL3 基因定位到染色体 9q33.3。