L 型异质核核糖核蛋白; HNRNPLL

HNRPLL
基质RNA调节因子; SRRF

HGNC 批准的基因符号:HNRNPLL

细胞遗传学位置:2p22.1 基因组坐标(GRCh38):2:38,561,969-38,602,928(来自 NCBI)

▼ 说明

HNRNPLL 是 T 细胞中激活诱导的选择性剪接的主要调节因子。特别是,它改变了 CD45(PTPRC; 151460) 的剪接,CD45 是 T 细胞发育和激活所必需的酪氨酸磷酸酶(Oberdoerffer et al., 2008)。

▼ 克隆与表达

Shur 等人通过免疫筛选人骨髓基质细胞 cDNA 文库(2004)克隆了 HNRNPLL 的 2 个选择性剪​​接亚型,他们将其称为 SRRF。推导的 HNRNPLL A 和 B 亚型分别包含 437 个和 508 个氨基酸,并共享 2 个 RNA 结合基序(RRM) 结构域。 HNRNPLL A 同工型包含第三个 RRM 结构域和 PTB、SH2 和 WW 相互作用基序。 HNRNPLL B 同工型包含卷曲螺旋区域、DNA 结合结构域以及 14-3-3 和 PDZ 相互作用基序。 HNRNPLL 亚型与 HNRNPL(603083) 具有 69% 的氨基酸同源性,与 HNRNPI(600693) 和 ROD1(607527) 蛋白具有 46% 的同源性。 RT-PCR 分析仅在骨髓基质细胞中检测到 HNRNPLL 转录物 A 和 B 的表达。通过数据库分析鉴定出 5-prime 和 3-prime 非翻译区不同的其他转录本。

▼ 基因功能

Oberdoerffer 等人使用短发夹 RNA 干扰筛选(2008) 确定 HNRNPLL 是 CD45 选择性剪接的关键诱导调节因子。 HNRNPLL 在受刺激的 T 淋巴细胞中表现出上调表达,结合 CD45 转录物,并且对于 CD45 选择性剪接是必要且充分的。 B 细胞系、T 细胞系以及原代 T 细胞中 HNRNPLL 的缺失或过度表达导致 CD45RA 和 CD45RO 表达的相互改变。外显子阵列分析表明,HNRNPLL 敲低导致 132 个基因(包括 CD45)中出现显着的替代外显子使用。激活后对脐带血(即初始)T 细胞的分析显示,其中 36 个基因具有显着的替代外显子使用,包括 CD45 外显子 4 和 6 的表达升高。奥伯多弗等人(2008) 提出造血细胞活化和分化过程中 HNRNPLL 的诱导可能使细胞快速改变其转录组以有利于增殖并抑制细胞死亡。

▼ 基因结构

舒尔等人(2004) 确定 HNRNPLL 基因包含 14 个外显子,其中外显子 5 和 7 具有选择性剪接。转录本 A 排除外显子 1 和外显子 7,而转录本 B 保留外显子 1 的一部分并排除外显子 5 和 7。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Shur 等人(2004) 将 HNRNPLL 基因对应到染色体 2p22。