FOXC1 上游转录，非编码; FOXCUT

长基因间非编码 RNA 1379； LINC01379
TCONS_00011636

HGNC 批准的基因符号：FOXCUT

细胞遗传学位置：6p25.3 基因组坐标（GRCh38）：6:1,605,531-1,607,358（来自 NCBI）

▼ 说明

长非编码 RNA（lncRNA），例如 FOXCUT，是长度超过 200 个核苷酸的转录 RNA 分子，不具有蛋白质编码潜力。它们被认为参与调节蛋白质编码基因的表达（Pan 等人的总结，2014）。

▼ 克隆与表达

使用生物信息学分析，Pan 等人（2014） 鉴定了 FOXCUT 位于 FOXC1 基因（601090） 启动子区域的上游。

▼ 基因功能

Pan 等人通过对 82 例食管鳞状细胞癌（ESCC；参见 133239） 进行实时定量 PCR 分析（2014）发现，与邻近的非癌组织相比，ESCC 中 FOXCUT 和 FOXC1 的表达显着上调。 FOXCUT 和 FOXC1 的上调与分化不良、晚期淋巴结分类、转移和不良预后相关。通过小干扰RNA敲低FOXCUT会降低FOXCUT和FOXC1的表达，而敲低FOXC1对FOXCUT表达没有影响。 FOXC1 或 FOXCUT 的敲低会抑制 ESCC 细胞的增殖、集落形成、迁移和侵袭潜力。潘等人（2014） 得出结论，FOXCUT 和 FOXC1 可能构成功能性 lncRNA-mRNA 基因对。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Pan 等人（2014） 将 FOXCUT 基因定位到染色体 6p25，位于 FOXC1 启动子的上游。