PUMILIO RNA 结合家族成员 2; PUM2

PUMILIO、果蝇、2 的同源物
KIAA0235

HGNC 批准的基因符号:PUM2

细胞遗传学位置:2p24.1 基因组坐标(GRCh38):2:20,248,691-20,352,253(来自 NCBI)

▼ 说明

PUM2 属于嘌呤结合转录因子家族,它与目标 mRNA 的 3-prime UTR 中的元件结合,影响 mRNA 的稳定性和/或翻译(Huang 等人总结,2014)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从人未成熟骨髓细胞系 KG-1 的 cDNA 文库中随机选择的 cDNA 进行测序(1996) 分离出编码 PUM2 的 cDNA,PUM2 是果蝇 Pumilio 蛋白的人类同源物,他们将其命名为 KIAA0235。预测的 850 个氨基酸的 KIAA0235 蛋白与 PUM1(607204) 具有 81.5% 的一致性。 Northern 印迹分析检测到所有测试组织中 KIAA0235 的表达。

Jaruzelska 等人通过免疫组织化学对成人睾丸中的 PUM2 进行定位(2003)在精原细胞中检测到丰富的表达,在核周细胞质中染色最强。 PUM2 和 NOS1(608226) 均在精母细胞减数分裂过程中表达,并且这两种蛋白都不存在于减数分裂后期生殖细胞中。

▼ 基因功能

在发育早期,胚胎的一部分被留出,成为生殖细胞谱系,最终分化形成精子和卵子,并将遗传信息传递给下一代。 Y 染色体 DAZ 基因缺失(参见 DAZ;400003)的男性几乎没有或没有生殖细胞,但在其他方面都很健康,表明他们在生殖细胞的形成或维持方面存在特定缺陷。 DAZ 同源物 DAZ 样(DAZL; 601486) 存在于包括人类在内的多种生物体中,并且是男性和/或女性生殖细胞发育所必需的。摩尔等人(2003) 表明,PUM2 是 Pumilio 的人类同源物,Pumilio 是维持果蝇和秀丽隐杆线虫种系干细胞所需的蛋白质,它通过 RNA 结合、蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质相互作用所需的相同功能域与 DAZ 形成稳定的复合物。拯救苍蝇中的普米利奥突变。他们还表明,PUM2 主要在人类胚胎干细胞和生殖细胞中表达,并与生殖细胞中的 DAZ 和 DAZL 共定位。这些数据表明 PUM2 是生殖细胞发育可能需要的保守细胞机制的一个组成部分。

通过共转染 COS-7 细胞的共免疫沉淀实验,Jaruzelska 等人(2003) 证明 PUM2 与 NOS1 相互作用。对截短突变体的酵母 2 杂交分析表明,PUM2 的一个区域(包括 RNA 结合结构域和 155 个上游氨基酸)与 NOS1 的锌指结构域相互作用。 PUM2 还通过与 NOS1 相互作用所需区域不同的区域形成同二聚体。

Huang 等人使用人类肿瘤和匹配的正常组织和癌细胞系(2014) 发现 PUM2 的表达与 SCCRO3(DCUN1D3; 616167) 的表达呈负相关,SCCRO3 是细胞生长、迁移和转化的负调节因子。人 16HBE 细胞中 PUM2 的过度表达会降低 SCCRO3 的表达。相反,敲低 H1299 细胞中的 PUM2 会增加 SCCRO3 mRNA。黄等人(2014) 得出结论,SCCRO3 是 PUM2 介导的 mRNA 衰减的靶标。

李等人(2016) 鉴定了一种长非编码 RNA NORAD(617037),其表达在 HCT116 人结肠癌细胞中以 p53(TP53; 191170) 依赖性方式诱导。 NORAD 表达的条件性敲除或敲低会导致多种有丝分裂错误,包括后期桥、有丝分裂滑移和显着的非整倍性。对与 NORAD 结合的蛋白质进行质谱分析,鉴定出 PUM2,它与 NORAD 序列中的几个 Pumilio 响应元件结合。蛋白质印迹分析还揭示了 PUM1 与 NORAD 的相互作用。交联和免疫沉淀分析表明,在 NORAD -/- 细胞中显着下调的 1,303 个基因中,193 个是 PUM2 靶标,这些靶标富含细胞周期、有丝分裂、DNA 修复和 DNA 复制的调节因子。 PUM1 或 PUM2 的过度表达引起与 NORAD -/- 细胞中发现的类似的基因表达变化,并且 PUM1 或 PUM2 的耗竭显着降低了 NORAD -/- 细胞中有丝分裂错误的频率。然而,PUM1 和 PUM2 的双敲除会导致有丝分裂错误,这表明需要最佳丰度的 Pumilio 蛋白来维持基因组稳定性。李等人(2016) 得出结论,NORAD 充当 Pumilio 蛋白的分子诱饵并稳定 Pumilio 靶标 mRNA。

▼ 测绘

通过对人类/啮齿动物杂交细胞系和辐射杂交细胞的分析,Nagase 等人(1996) 将 KIAA0235 基因定位到 2 号染色体。

Hartz(2015) 根据 PUM2 序列(GenBank D87078) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PUM2 基因对应到染色体 2p24.1。