锌指 CCHC 域包含蛋白 4; ZCCHC4
HGNC 批准的基因符号:ZCCHC4
细胞遗传学位置:4p15.2 基因组坐标(GRCh38):4:25,312,774-25,370,383(来自 NCBI)
▼ 说明
ZCCHC4 是一种 N6-甲基腺苷(m6A) 甲基转移酶,可介导核糖体 RNA(rRNA) 甲基化(Ma et al., 2019)。
▼ 克隆与表达
通过使用线虫 Lsm12 的 C 端甲基转移酶结构域作为查询来搜索数据库,Albrecht 和 Lengauer(2004) 鉴定出了人类 ZCCHC4。 ZCCHC4 蛋白含有侧翼为锌指的甲基转移酶结构域。
使用免疫荧光分析,Ma 等人(2019)表明,在转染的 HeLa 细胞中,人 ZCCHC4 定位于细胞质并积累在核仁中。作者指出,人类 ZCCHC4 有 2 种亚型,一种是全长亚型,另一种是保留甲基转移酶结构域的较短亚型。
▼ 基因功能
马等人(2019) 发现人类 ZCCHC4 充当 28S rRNA 的 m6A 甲基转移酶。在 HepG2 和 HeLa 细胞中敲除 ZCCHC4 证实,ZCCHC4 是负责在 28S rRNA 残基 A4220 处安装 m6A 的主要甲基转移酶。 ZCCHC4 影响细胞中的整体翻译,很可能是通过其 28S rRNA m6A 甲基化活性。基因本体分析表明,ZCCHC4 影响涉及膜蛋白靶向、mRNA 分解代谢过程、内质网定位和翻译起始的基因表达。与对照组相比,ZCCHC4 敲除的 HepG2 细胞的细胞增殖显着减少,并且 ZCCHC4 在肝细胞癌肿瘤组织中过度表达,导致更高的 m6A 甲基化和肿瘤进展。
van Tran 等人孤立地(2019) 鉴定人 ZCCHC4 是负责 28S rRNA 上 N6 甲基化 A4220 的甲基转移酶。 ZCCHC4 专门修饰 28S rRNA,不作用于其他 RNA 底物。
▼ 测绘
Gross(2017) 根据 ZCCHC4 序列(GenBank AF161537) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ZCCHC4 基因对应到染色体 4p15.2。