TAF3 RNA 聚合酶 II，TATA 框结合蛋白相关因子，140-KD； TAF3

TBP 相关因子，RNA 聚合酶 II，140-KD； TAFII140

HGNC 批准的基因符号：TAF3

细胞遗传学位置：10p14 基因组坐标（GRCh38）：10:7,818,505-8,016,631（来自 NCBI）

▼ 说明

高度保守的 RNA 聚合酶 II（pol II） 转录因子 TFIID（参见 TAF1；313650）包含 TATA 框结合蛋白（TBP；600075）和一组 TBP 相关因子（TAF），包括 TAF3。 TAF 有助于启动子识别和选择性，并充当抗凋亡因子（Gangloff 等，2001）。除了在 TFIID 中的作用外，TAF3 还可以与其他几种转录因子相互作用来控制基因表达（Liu et al., 2011）。

▼ 克隆与表达

Gangloff等人通过EST数据库搜索与酵母Tafii47的组蛋白折叠结构域（HFD）相似的序列，然后探测HeLa细胞cDNA文库（2001）获得了编码 TAF3 的部分 cDNA，他们将其命名为 TAFII140。推导的 727 个氨基酸的蛋白含有 N 端 HFD，与小鼠 Tafii140 高度同源。 932 个氨基酸的小鼠蛋白具有 C 端植物同源结构域（PHD） 指，基因组数据库分析表明该基序存在于人 TAF3 中。

Liu 等人使用蛋白质印迹分析（2011）发现Taf3在小鼠胚胎干细胞系和杂交瘤中高表达，而在其他细胞类型中表达低得多。在小鼠脾脏中检测到低 Taf3 表达，但在心脏、脑、肺或肝脏中未检测到。胚胎干细胞分化为胚状体后，Taf3 被下调。

▼ 基因功能

Gangloff 等人使用酵母 2-杂交分析（2001） 表明小鼠 Tafii140 通过 HFD 与人类 TAFII30（TAF10; 600475） 相互作用。免疫沉淀分析检测到 TAF3 的核表达为 140 kD 蛋白，显然与 TBP 和 TAFII18（TAF13; 600774） 以及 SAP130（SF3B3; 605592） 和 GCN5（参见 602301） 形成复合物。

组蛋白 H3（参见 602810）在 lys4（H3K4me3） 处的三甲基化是活性人类启动子的标志。 Vermeulen 等人在基于细胞培养（SILAC） 的蛋白质组筛选中使用氨基酸稳定同位素标记（2007）表明TFIID通过TFIID亚基TAF3的PHD直接结合H3K4me3。 H3K4me3 的选择性丢失减少了体内启动子子集的转录和 TFIID 与启动子子集的结合。平衡结合测定和竞争实验表明TAF3 PHD指对H3K4me3具有高度选择性。在瞬时测定中，TAF3 可以以 PHD 指依赖性方式充当转录激活剂。 H3 在 arg2 处的不对称二甲基化选择性抑制 TFIID 与 H3K4me3 的结合，而 H3 在 lys9 和 lys14 处的乙酰化则增强了 TFIID 与 H3K4me3 的相互作用。韦尔默伦等人（2007） 得出结论，组蛋白修饰和 TFIID 之间存在串扰。

Liu 等人通过短发夹 RNA 敲低 Taf3 表达（2011）发现Taf3在维持小鼠胚胎干细胞的多能性方面具有关键作用。基因表达谱显示，Taf3 的敲除主要导致神经程序的表达和内胚层程序的下调。染色质免疫沉淀和测序表明，Taf3 在启动子处的结合与 pol II、Taf1 和 Tbp 的存在呈正相关。 Liu 等人利用全基因组结合研究（2011） 鉴定了另外 3 类富含 Taf3 结合的染色体区域：包括 Oct4（POU5F1; 164177）、Nanog（607937）、Sox2（184429） 和介体成分（参见 604311）；那些包括 Ctcf（604167） 和粘连蛋白亚基 Smc1a（300040） 和 Smc3（606062） 的；以及仅富集 Taf3 的那些。 Taf3 与核心启动子处的 Ctcf 和粘连蛋白的关联与来自远端位点的 DNA 环相关。 DNA 环化通过 Taf3 激活基因 Mapk3（601795） 和 Psmd1（617842） 进行了特别观察。这些基因的表达在 Taf3 或 Ctcf 敲低后降低，并且随着 Taf3 和 Ctcf 的耗尽而进一步降低。刘等人（2011） 得出结论，TAF3 可以在几种不同的情况下结合 DNA，并且 TAF3 在维持胚胎干细胞多能性方面发挥着重要作用。

▼ 测绘

Hartz（2012） 根据 TAF3 序列（GenBank AJ292190） 与基因组序列（GRCh37） 的比对，将 TAF3 基因对应到染色体 10p14。