长基因间非编码 RNA 261; LINC00261

FOXA2-相邻长非编码 RNA; FALCOR
肝细胞癌 RNA 1 下调; HCCDR1
定形内胚层相关长非编码 RNA 1; DEANR1

HGNC 批准的基因符号:LINC00261

细胞遗传学位置:20p11.21 基因组坐标(GRCh38):20:22,560,553-22,578,642(来自 NCBI)

▼ 说明

长非编码 RNA,例如 LINC00261,是超过 200 个核苷酸的 RNA,不编码蛋白质,但参与基因表达的调节(Swarr et al., 2019)。

▼ 克隆与表达

斯瓦尔等人(2019) 指出,linc00261(他们称之为 Falcor)首次在发育中的小鼠肺部表达的 lncRNA 筛选中被发现,位于转录因子 Foxa2(600288) C 末端下游约 2 kb 处。人类 FALCOR 和 FOXA2 的定位相似。斯瓦尔等人(2019) 表明,尽管人类和小鼠 Falcor 的一级序列保守性总体较差,但启动子区域、转录起始位点和第一个外显子在所有灵长类动物和胎盘哺乳动物中都表现出很强的保守性。 Falcor 和 Foxa2 在整个小鼠发育过程中表现出几乎相同的表达模式,在神经管和内胚层衍生器官(包括肺、肝、肠和胰腺)中观察到强表达。 Falcor 和 Foxa2 在发育中的小鼠和人肺中高度表达。在成年小鼠中,气道上皮细胞中的 Falcor 和 Foxa2 水平最高。在肺上皮中,Falcor 的亚细胞定位主要是细胞核。

▼ 测绘

斯瓦尔等人(2019) 指出,LINC00261 位于 FOXA2 基因 3-prime 末端下游约 2 kb 处,该基因对应到染色体 20p11。小鼠 Linc00261 基因与 Foxa2 基因的位置相似。

▼ 基因功能

刘等人(2017) 指出,LINC00261 在非小细胞肺癌(NSCLC;参见 211980) 中显着下调,并且表达水平与总体较差的生存率相关。

斯瓦尔等人(2019) 确定了 Foxa2-Falcor 监管反馈回路。 Foxa2 通过与其启动子结合来抑制 Falcor 表达。反过来,Falcor 以顺式作用上调 FoxA2。在 Falcor 基因敲除小鼠模型中,作者注意到与野生型小鼠相比,肺部存在慢性炎症变化以及上皮损伤后的修复缺陷。他们还观察到,干扰调节环路会导致细胞粘附和迁移改变,从而导致慢性支气管周围气道炎症和杯状细胞化生。