寡聚高尔基复合体 2 的组成部分; COG2

低密度脂蛋白受体缺陷 C 互补蛋白;LDLC

HGNC 批准的基因符号:COG2

细胞遗传学位置:1q42.2 基因组坐标(GRCh38):1:230,642,481-230,693,982(来自 NCBI)

▼ 说明

多蛋白复合物是高尔基体结构及其细胞内转移和糖蛋白修饰能力的关键决定因素。已鉴定出几种复合物,包括高尔基体转运复合物(GTC)、参与糖基化反应的 LDLC 复合物以及参与囊泡转运的 SEC34 复合物。这 3 个复合体是相同的,被称为保守寡聚高尔基体(COG) 复合体,其中包括 COG2(Ungar 等,2002)。

▼ 克隆与表达

波多斯等人(1994) 通过在 ldlC 中国仓鼠卵巢(CHO) 细胞中表达人类基因组 DNA,孤立出编码 LDLC 的 cDNA,该细胞由于糖基化缺陷而具有缺陷 LDLR(606945) 表达,检测正确的表达,探测大小选择的基因组 DNA 文库,Northern HeLa 细胞的印迹分析,以及 HeLa 细胞 cDNA 文库的筛选。 ldlC CHO 细胞中仅 LDLC 表达,但 ldlB(606973) CHO 细胞中不表达,校正了 LDLR 表达。 Northern 印迹分析揭示了 HeLa 细胞中 3.4 kb LDLC 转录物的表达,在野生型 CHO 细胞中表达较低,但在突变型 CHO 细胞中没有表达。 LDLC 是一种推导的 738 个氨基酸的细胞质蛋白。免疫荧光显微镜表明LDLC与CHO细胞和小鼠成纤维细胞中的高尔基体相关。

Ungar 等人通过 SDS-PAGE 分析牛脑细胞质(2002) 鉴定了 COG 复合物的 8 个亚基。免疫荧光显微镜证明 COG1(LDLB) 与 COG7(606978)、COG3(606975) 和 COG5(606821) 共定位,并且高尔基体标记物分布在核周。免疫沉淀分析表明所有 COG 亚基均与 COG2 相互作用。翁加尔等人(2002) 得出结论,COG 复合体对于高尔基体的结构和功能至关重要,并且可以影响细胞内膜转移。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 COG2 基因测绘到 1 号染色体(stSG15532)。

▼ 分子遗传学

Kodera 等人在一名 6 岁男孩中发现,该男孩的父母无关,患有先天性糖基化 IIq 型疾病(CDG2Q;617395)(2015) 鉴定了 COG2 基因中的复合杂合突变(606974.0001-606974.0002)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实;一种突变是从头发生的,而另一种突变是从未受影响的母亲那里继承的。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 先天性糖基化障碍,IIq 型(1 名患者)
COG2、1-BP DUP、NT701

Kodera 等人在一名 6 岁男孩中发现,该男孩的父母无关,患有先天性糖基化 IIq 型疾病(CDG2Q;617395)(2015) 鉴定了 COG2 基因中的复合杂合突变:1-bp 重复(c.701dup),导致移码和提前终止(Tyr234Ter),以及 c.1900T-G 颠换,导致 trp634 变为-在高度保守的残基处进行甘氨酸(W634G;606974.0002)取代。这些突变是通过全外显子组测序发现并通过桑格测序确认的,在 dbSNP(版本 137)或外显子组测序项目数据库或包含 575 个对照外显子组的内部数据库中均未发现这些突变。 c.701dup 突变在父亲等位基因上从头发生,而 W634G 突变是从未受影响的母亲遗传的。对患者细胞的分析表明,c.701dup 突变导致无义介导的 mRNA 衰减。患者成纤维细胞的蛋白质印迹分析显示 COG2 表达下降,以及 COG3(606975) 和 COG4(606976) 表达下降,表明 COG 复合物的完整性被破坏。

.0002 先天性糖基化障碍,IIq 型(1 名患者)
COG2、TRP634GLY

讨论 COG2 基因中的 c.1900T-G 颠换,导致 trp634-to-gly(W634G) 取代,该取代在患有 IIq 型先天性糖基化疾病的患者的复合杂合状态中发现(CDG2Q; 617395)小寺等人(2015),参见 606974.0001。