核糖体蛋白 S29; RPS29
HGNC 批准的基因符号:RPS29
细胞遗传学位置:14q21.3 基因组坐标(GRCh38):14:49,570,988-49,598,710(来自 NCBI)
▼ 说明
RPS29 基因编码 40S 核糖体小亚基的一个组成部分,对于 rRNA 加工和核糖体生物发生至关重要(Mirabello 等人总结,2014)。
▼ 克隆与表达
Frigerio 等人通过从人类结直肠 cDNA 文库中随机选择 cDNA 的部分序列来搜索序列数据库(1995)鉴定了编码大鼠核糖体蛋白S5(RPS5; 603630)、S9(RPS9; 603631)、S10(RPS10; 603632)、S29(RPS29)、L5(RPL5; 603634)、L21(RPL21; 603636)同源物的cDNA 、L27a(RPL27A;603637)和L28(RPL28;603638)。弗里杰里奥等人(1995) 完成了这些人类核糖体蛋白的 cDNA 序列。推导的 56 个氨基酸的人 RPS29 与大鼠 Rps29 相同。 Northern印迹分析表明,与邻近正常组织相比,结直肠癌中RPS29的表达存在差异,尽管没有发现表达水平与疾病严重程度之间的相关性。
近藤等人(1996)通过使用源自结肠癌细胞系(HT29)和分化亚克隆(C III)的探针对人结肠癌cDNA文库进行差异杂交筛选来分离RPS29 cDNA。 Northern印迹分析检测到,与分化的C III细胞相比,未分化的HT29细胞中0.3-kb RPS29转录物的水平更高,与快速增殖的HT29细胞相比,生长停滞的HT29细胞中的0.3-kb RPS29转录物水平更高。 RPS29 具有可结合锌的锌指样结构域。作者证明 RPS29 可以增强 KREV1(179520) 的肿瘤抑制活性。
▼ 测绘
通过体细胞杂交和辐射杂交作图分析,Kenmochi 等人(1998) 将人类 RPS29 基因定位到染色体 14q。
▼ 分子遗传学
Mirabello 等人在患有 Diamond-Blackfan 贫血 13(DBA13; 615909) 的 2 个不相关家庭的受影响成员中(2014) 鉴定了 RPS29 基因中的杂合错义突变(603633.0001 和 603633.0002)。通过全外显子组测序发现的突变与家族中的疾病分开;然而,两个家庭都显示出不完全外显的证据。功能研究表明,突变导致 RPS29 单倍体不足。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 钻石-黑风扇贫血 13
RPS29、ILE31PHE
Mirabello 等人在患有 Diamond-Blackfan 贫血 13(DBA13; 615909) 的 5 名受影响家庭成员中(2014) 在 RPS29 基因的外显子 2 中发现了一个杂合的 c.121T-A 颠换,导致重要结构域中高度保守的残基发生 ile31 到 phe(I31F) 的取代。该突变是通过全外显子组测序发现并通过直接测序验证的,在外显子组测序项目、dbSNP(版本 137)或 1000 基因组计划数据库或 1,000 个内部对照外显子组中不存在。一名未受影响的家庭成员不携带该突变,但另一名未受影响的家庭成员确实携带该突变,表明不完全外显。患者细胞表现出典型 RPS29 同种型的单倍体不足以及前 rRNA 加工缺陷,18S rRNA 亚基的 3 引物末端成熟不完全。
.0002 钻石-黑风扇贫血 13
RPS29,ILE50THR
Mirabello 等人在一名患有 DBA13(615909) 的 25 岁男性中(2014) 在 RPS29 基因的外显子 2 中发现杂合性 c.179A-G 转换,导致重要结构域中高度保守的残基发生 ile50 至 thr(I50T) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并通过直接测序验证的,在外显子组测序项目、dbSNP(版本 137)或 1000 基因组计划数据库或 1,000 个内部对照外显子组中不存在。一名专性携带者的红细胞腺苷脱氨酶升高,另一名专性携带者未受影响,表明外显率不完全。患者细胞显示出典型 RPS29 亚型的单倍体不足。 I50T 突变在 rps29 缺失的斑马鱼中的表达未能挽救造血缺陷。