重组率数量性状基因座 1; RRQTL1

有证据表明重组率(RRQTL1) 是由染色体 4p16 上的 RNF212 基因(612041) 的变异赋予的。

▼ 说明

重组在减数分裂中起着至关重要的作用,确保染色体的正确分离。连锁不平衡(LD) 和精子分型研究表明,整个人类基因组的重组率差异很大,大多数事件发生在狭窄的热点区域(Coop 等,2008)。

为了检查个体之间精细重组模式的变化,Coop 等人(2008)使用在核心家族中收集的密集全基因组核苷酸多态性数据来以高空间分辨率定位交叉。该分析表明,男性和女性的总体重组热点使用情况相似,个别热点通常在两性中都很活跃。在整个基因组中,大约 60% 的交叉发生在 LD 研究推断的热点中(在 17、19、10 和 11 号染色体上)。然而,值得注意的是,库普等人(2008)发现男性和女性在这些热点地区发生的交叉比例存在广泛且可遗传的差异。

▼ 分子遗传学

孔等人(2008) 通过对 1,887 名男性和 1,702 名女性进行基因分型并估计重组率,对与重组率相关的变异进行了全基因组扫描。通过加权回归分别研究男性和女性重组率,其中一个人的体重与用于估计重组率的儿童数量成正比。对于雄性重组率,3个单核苷酸多态性(SNP)达到全基因组显着性(P小于1.6 x 10(-7))。它们是 rs3796619(612041.0001)(P = 1.1 x 10(-14))、rs1670533(612041.0002)(P = 1.8 x 10(-11)) 和 rs2045065(P = 1.6 x 10(-11)),均位于在染色体 4p16.3 上的一个小区域内,存在强连锁不平衡。相同的 3 个 SNP 也与女性重组率相关。最后 2 个 SNP 具有全基因组意义;没有其他 SNP 这样做。然而,当孔等人(2008)比较男性和女性,3个SNP分别显示相反的效果。例如,rs3796619的等位基因T与男性的低重组率相关,但与女性的高重组率相关。这 3 个 SNP 在 1,248 名男性和 1,663 名女性的复制样本中进行了基因分型,也可获得重组率估计值。总共 4,388 个核心家族和 19,578 个个体通过全基因组微卫星标记进行了基因分型,最终的重组率估计结果证实了最初的关联。合并样本后,rs3796619 显示出与雄性重组率最强的相关性(P = 3.2 x 10(-24)),并且等位基因 T 的每个拷贝(与 C 相比)估计可将重组率降低 70.7 cM。对于女性重组率,SNP rs1670533 显示出最强的关联(P = 1.9 x 10(-12)),并且相对于 TT 纯合子,估计等位基因 C 的每个拷贝将重组率增加 88.2 cM。第三个SNP rs2045065 与rs1670533 高度相关(r(2) = 0.99),并且无法区分它们的作用。这些变体位于 RNF212 基因(612041) 内,该基因编码可能是泛素连接酶的环指蛋白。基因直系同源预测表明哺乳动物 RNF212 基因与参与减数分裂重组的线虫 Zhp3 基因具有同源性。