1 型糖尿病 19； T1D19

糖尿病，胰岛素依赖型，19； IDDM19

细胞遗传学位置：2q24.3 基因组坐标（GRCh38）：2:162,900,001-168,900,000

▼ 测绘

史密斯等人（2006） 发现 IFIH1 基因（A946T; rs1990760） 中的非同义 SNP 与 IDDM（222100） 之间存在关联。在 4,253 个病例、5,842 个对照和 2,134 个亲子三基因型中，SNP 次要等位基因的风险比为 0.86，P = 1.42 x 10（-10）。为了检验 rs1990760 是该区域唯一因果变异的假设，作者在 SNP 周围划定了一个 236 kb 的区域，并根据 60 个 CEPH 个体的基因型选择了位于该区域内的常见 SNP。 2q24.3 上的疾病相关区域包括 4 个基因：成纤维细胞激活蛋白（FAP; 600403）、IFIH1、小钙蛋白（GCA; 607030） 和钾电压门控通道亚家族 H 成员 7（KCNH7; 608169）。史密斯等人（2006） 认为 IFIH1 基因是因果位点最强的功能候选基因，因为它作为病毒感染双链 DNA 的受体，以及病毒感染和 IDDM 易感性之间的流行病学和实验关联。

刘等人（2009） 对来自美国的 2,046 名白种人 1 型糖尿病（T1D） 患者和 2,417 名正常对照者的 5 个基因组区域的 SNP 进行了基因分型。作者仅在染色体 2q 上的 IFIH1 连锁不平衡（LD） 块中发现了 T1D 与多个 SNP 之间关联的有力证据。外周血单个核细胞中IFIH1基因表达水平与IFIH1基因型显着相关，易感基因型个体中IFIH1水平较高（P = 0.005）。

为了确定 T1D 致病变异，Nejentsev 等人（2009） 对 480 名患者和 480 名对照者 DNA 库中 10 个候选基因的外显子和剪接位点进行了重新测序，并在 30,000 多名参与者中测试了它们与疾病的关联。他们在 IFIH1 中发现了 4 个孤立降低 T1D 风险的罕见变异，IFIH1 是一个位于先前通过全基因组关联研究与 T1D 相关的区域的基因。相关性最高的变异是 rs35667974，它将外显子 14 密码子 923（I923V） 处高度保守的 ile 更改为 val（病例对照研究中的 OR，0.51，95% CI 0.43-0.61；家庭研究中的相对风险， 0.60，95% CI 0.45-0.82，合并 P = 2.1 x 10（-16））。这些变异预计会改变 IFIH1 的表达和结构，IFIH1 是一种细胞质解旋酶，介导诱导对病毒 RNA 的干扰素反应。内杰采夫等人（2009） 得出的结论是，他们的发现牢固地确立了 IFIH1 在 T1D 中的作用，并证明重测序研究可以查明最初由全基因组关联研究确定的基因组区域中的致病基因。内杰采夫等人（2009） 还证实了 Smyth 等人鉴定的 rs1990760 的关联（2006）和刘等人（2009）。