配体依赖性核受体核抑制子; LCOR
MBLK1 相关蛋白 2; MLR2
KIAA1795
此条目中涉及的其他实体:
CHROMOSOME 10 开放解读码组 12,已包含; C10ORF12,包含
包括 PRC2 相关的 LCOR 同工型 1; PALI1,包括
HGNC 批准的基因符号:LCOR
细胞遗传学位置:10q24.1 基因组坐标(GRCh38):10:96,832,298-96,995,956(来自 NCBI)
▼ 说明
LCOR 是一种在胎儿和成人组织中广泛表达的转录辅阻遏物,通过单个 LxxLL 基序(也称为核受体(NR) 框)被招募到激动剂结合的核受体(Fernandes 等,2003)。
脊椎动物特有的 LCOR 同工型 PALI1 是多梳抑制复合体 2(PRC2) 的组成部分,可介导组蛋白 H3 的甲基化(参见 602810)lys27(H3K27)(Conway 等人,2018)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2001) 克隆了 LCOR,他们将其称为 KIAA1795。推导的KIAA1795蛋白含有572个氨基酸。 RT-PCR 和 ELISA 检测到肝脏、睾丸和卵巢中表达最高,其次是肾脏和大脑。在大脑内,杏仁核、胼胝体和尾状核中检测到最高表达。
Fernandes 等人通过使用 ESR1(133430) 的配体结合域作为诱饵对胎儿肾脏 cDNA 文库进行酵母 2 杂交分析,然后筛选前列腺 cDNA 文库并搜索 EST 数据库(2003)克隆了LCOR。预测的 433 个氨基酸的 LCOR 蛋白的计算分子量约为 47 kD。它包含一个 LxxLL 基序、一个核定位信号和一个螺旋-环-螺旋结构域。 Northern印迹分析检测到LCOR转录物在成人和胎儿组织中以不同水平广泛表达,其中在胎盘、小脑和胼胝体、成人肾脏和许多胎儿组织中表达最高。
国枝田等人(2003) 克隆了小鼠 Lcor,根据其与蜜蜂转录因子 Mblk1 的同源性,他们将其称为 Mlr2。推导的 433 个氨基酸蛋白包含 DNA 结合基序和 Mlr1 中保守的基序(LCORL; 611799)。 Northern blot分析检测到Mlr2在小鼠肾脏、肝脏和心脏中表达,在脑中表达较弱,在睾丸中无表达。
通过对原代人乳腺上皮细胞 cDNA 文库进行 RT-PCR,Conway 等人(2018)克隆了一个 LCOR 剪接变体,他们称之为 PALI1。推导的 1,557 个氨基酸的 PALI1 同工型包含 LCOR 同工型的前 111 个氨基酸,后面是 199 个独特的氨基酸和由 C10ORF12 编码的 1,247 个氨基酸。蛋白质印迹分析检测到 260-kD PALI1 蛋白。 HEK293T细胞中的外显子特异性敲低实验表明,LCOR和PALI1代表LCOR基因的孤立变体,而C10ORF12代表PALI1的一部分而不是孤立变体。 PALI1 直向同源物的数据库分析揭示了由 LCORL 基因(611799) 编码的相关亚型 PALI2。 PALI1 和 PALI2 亚型在脊椎动物中高度保守,但在无脊椎动物中不存在。
▼ 基因功能
费尔南德斯等人(2003) 确定 LCOR 与 ESR1 的结合部分取决于 ESR1 共激活剂结合口袋中的残基,与 TIF2 结合的残基不同(601993)。 LCOR 的抑制可以被组蛋白脱乙酰酶(HDAC;参见 601241)抑制剂曲古抑菌素 A 以受体依赖性方式消除,这表明作用模式依赖于 HDAC 和不依赖于 HDAC。 LCOR 在体外和体内直接与特定 HDAC 结合。此外,LCOR 通过 2 个共有结合基序招募 C 端结合蛋白(CTBP;参见 602618)辅阻遏物来发挥作用,并与细胞核中的 CTBP 共定位。费尔南德斯等人(2003) 得出结论,LCOR 代表一类辅阻遏物,可通过多种机制减弱激动剂激活的核受体信号传导。
Kunieda 等人使用报告基因检测(2003) 表明小鼠 Mlr2 结合并激活蜜蜂 Mblk1 识别的 DNA 元件的转录。
Alekseyenko 等人使用交联和串联亲和纯化(2014) 发现人类 C10ORF12 和 C17ORF96(EPOP; 617795) 与 EZH2(601573) 相互作用,EZH2(601573) 是 Polycomb 抑制复合体 2(PRC2) 的核心成分。 293T 细胞的交互实验证实,LCOR 和 EPOP 会降低核心 PRC2 亚基。然而,在相同的 PRC2 复合体中没有发现 LCOR 和 EPOP。 LCOR 和 EPOP 还与 MTF2(609882) 和泛素特异性蛋白酶 USP7(602519) 相互作用,MTF2 与 lys36(H3K36me3) 上三甲基化的组蛋白 H3(参见 602810)结合。染色质免疫沉淀分析显示 LCOR 和 EPOP 的全基因组富集域与 EZH2 和 H3K27me3 的富集域密切匹配。
康威等人(2018) 指出,PRC2 复合物有 2 种形式:PRC2.1,具有 1 个多梳状蛋白(例如 PHF1、602881);PRC2.2,包括 AEBP2(617934) 和 JARID2(601594)。康威等人(2018) 将 PALI1 和 PALI2 确定为 PRC2.1 复合体的组成部分。 Pali1 促进 PRC2 甲基转移酶活性,对于小鼠发育至关重要。染色质免疫沉淀分析显示,含有 PRC2.1 复合物的 Aebp2 缺失小鼠胚胎干细胞仅 H3K27 三甲基化增加,而含有 PRC2.2 复合物的 Pali1 和 Pali2 缺失小鼠胚胎干细胞仅 H3K27 三甲基化减少。作者得出结论,PALI1 和 PALI2 或 AEBP2 的存在或缺失会改变 PRC2 复合物的功能,并且可能对于确定正常发育和癌症期间的甲基化状态很重要。
▼ 基因结构
费尔南德斯等人(2003)确定LCOR基因含有7个外显子,其中包括4个短的5-prime非翻译区外显子,其中含有几个框内终止密码子。
▼ 测绘
长濑等人(2001) 通过辐射杂交分析将 LCOR 基因定位到 10 号染色体。通过基因组序列分析,费尔南德斯等人(2003) 将 LCOR 基因定位到染色体 10q24.1。