LIM 和富含半胱氨酸的结构域 1; LMCD1
HGNC 批准的基因符号:LMCD1
细胞遗传学位置:3p25.3 基因组坐标(GRCh38):3:8,501,823-8,574,668(来自 NCBI)
▼ 说明
LMCD1 蛋白含有 2 个 C 端 LIM 结构域,它们是大约 55 个氨基酸、富含半胱氨酸的结构,含有 2 个锌指。它们被认为参与蛋白质-蛋白质相互作用(Bespalova 和 Burmeister 总结,2000)。
▼ 克隆与表达
Bespalova 和 Burmeister(2000) 偶然发现了人类 LMCD1 cDNA 的 3-prime 末端。通过使用该 cDNA 作为查询并通过 RT-PCR 搜索 EST 数据库,他们分离出了完整的 LMCD1 编码区。预测的 365 个氨基酸的 LMCD1 蛋白在 N 端区域包含一个新的富含半胱氨酸的结构域,在 C 端区域包含 2 个 LIM 结构域。它还具有多个潜在的磷酸化和 N-肉豆蔻酰化位点以及一个潜在的 N-糖基化位点。 LMCD1 与 小鼠 Tes1(126255)、小鼠 Tes2、人 LMO6(300111) 和人三重 LIM 结构域蛋白具有显着的氨基酸序列同一性。 Northern 印迹分析在大多数测试的成人和胎儿组织中检测到主要的 1.7-kb LMCD1 转录物,其中在骨骼肌中表达最高。在胎儿和成人的大脑和肝脏以及成人胸腺、小肠和外周血中发现很少或没有 LMCD1 表达。
▼ 测绘
Bespalova 和 Burmeister(2000) 通过辐射杂交图谱将人类 LMCD1 基因定位到 3p26-p24。他们将小鼠 Lmcd1 基因定位到染色体 6 的中心区域,该区域显示出与人类 3p26-p24 同线性的同源性。