损伤调节自噬调节剂 2; DRAM2
跨膜蛋白 77; TMEM77
HGNC 批准基因符号:DRAM2
细胞遗传学位置:1p13.3 基因组坐标(GRCh38):1:111,117,163-111,140,093(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索 DRAM1(610776) 相关序列,O'Prey 等人(2009) 确定了 DRAM2。推导的 266 个氨基酸的 DRAM2 蛋白与 DRAM1 有 45% 的同一性。 Northern 印迹分析检测到 DRAM2 在大多数检查组织中都有不同的表达,其中在胎盘和心脏中表达最高,在脑和胸腺中表达很少或没有。免疫组织化学分析表明 DRAM2 与溶酶体标记物共定位。
Park 等人孤立地(2009) 通过数据库分析确定了 DRAM2。推导的 266 个氨基酸蛋白具有 6 个假定的跨膜结构域和 DRAM1 中未发现的独特的 21 个氨基酸 C 端区域。蛋白质印迹分析检测 HEK293 细胞中表观分子质量为 35 kD 的内源 DRAM2。免疫组织化学分析表明 DRAM1 和 DRAM2 共定位于溶酶体中。
El-Asrag 等人在出生后第 30 天使用小鼠视网膜的共聚焦免疫荧光显微镜观察(2015) 观察到 DRAM2 定位于感光层的内段和视网膜色素上皮的顶端表面。
▼ 测绘
Hartz(2010) 根据 DRAM2 序列(GenBank AK075350) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 DRAM2 基因对应到染色体 1p13.3。
▼ 基因功能
Park 等人使用半定量 PCR 和蛋白质印迹分析(2009)表明,与匹配的正常组织相比,大多数卵巢癌中 DRAM2 mRNA 和蛋白质的表达下调。 HEK293 细胞中 DRAM1 或 DRAM2 的过度表达不会改变细胞活力,但两种蛋白的共表达会增加细胞凋亡。在人结肠癌细胞系中沉默 DRAM2 可防止 p53(TP53; 191170) 诱导的细胞死亡,表明 DRAM2 在 p53 介导的细胞凋亡中发挥作用。
▼ 分子遗传学
El-Asrag 等人在来自 5 个不相关家庭的锥杆营养不良 21(CORD21; 616502) 患者中(2015) 鉴定了 DRAM2 基因中的纯合或复合杂合突变(参见例如 613360.0001-613360.0005)。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 锥杆营养不良 21
DRAM2,1-BP DEL,140G
El-Asrag 等人在患有成人发病性视网膜营养不良并早期黄斑受累的 5 代近亲巴基斯坦家庭的受影响成员中(CORD21;616502)(2015) 鉴定了 DRAM2 基因外显子 4 中 1 bp 缺失(c.140delG, NM_178454.4) 的纯合性,导致移码,预计会导致过早终止密码子(Gly47ValfsTer3)。这种突变在家族中随疾病分离,在 159 个种族匹配的对照或 dbSNP 或外显子组变异服务器数据库中均未发现;然而,ExAC 数据库中 61,486 个无关个体中的 1 个在杂合状态下检测到 1-bp 缺失。
.0002 锥杆营养不良 21
DRAM2,TRP165TER(rs201422368)
El-Asrag 等人在一名患有成人视网膜和黄斑营养不良(CORD21; 616502) 的 47 岁欧洲血统女性中进行了研究(2015) 鉴定了 DRAM2 基因外显子 6 中 c.494G-A 转变的复合杂合性,导致 trp165-to-ter(W165X) 取代,以及外显子 3 中的 c.131G-A 转变,导致高度保守残基处的 ser44 至 asn(S44N;613360.0003)替换。在 dbSNP、Exome Variant Server 或 ExAC 数据库中未发现 S44N 突变;然而,c.494G-A 变体在 dbSNP 数据库(rs201422368) 中进行了注释,并且在外显子组变体服务器和 ExAC 数据库中以杂合状态存在,次要等位基因频率分别为 0.008% 和 0.003%。
.0003 锥杆营养不良 21
DRAM2、SER44ASN
讨论 DRMA2 基因中的 c.131G-A 转变(c.131G-A,NM_178454.4),导致 ser44 到 asn(S44N) 取代,该取代在患有以下疾病的患者中以复合杂合状态发现:成人发病的视网膜和黄斑营养不良(CORD21; 616502),作者:El-Asrag 等人(2015),参见 613360.0002。
.0004 锥杆营养不良 21
DRAM2、3-BP DEL、NT64
El-Asrag 等人在一名患有视网膜营养不良(CORD21; 616502) 的印度女性中进行了研究(2015) 鉴定了 DRAM2 基因外显子 3 中 3 bp 缺失(c.64_66del, NM_178454.4) 的纯合性,导致第一个跨膜结构域中丙氨酸残基(Ala22del) 的框内缺失。她的近亲父母都是杂合子缺失,未受影响的姐妹也是如此。她四十多岁时的检查显示黄斑病变,全视野视网膜电图正常,表明不存在全身性视网膜功能障碍。
.0005 锥杆营养不良 21
DRAM2、HIS121LEU
El-Asrag 等人在一名患有成人视网膜和黄斑营养不良(CORD21; 616502) 的 47 岁南亚男性中进行了研究(2015) 鉴定了 DRAM2 基因外显子 6 中 c.362A-T 颠换(c.362A-T,NM_178454.4)的纯合性,导致高度保守的残基处发生 his121 至 leu(H121L) 取代。在 dbSNP、Exome Variant Server 或 ExAC 数据库中未发现该突变与家族中的疾病分离。患者 34 岁时出现中心视力丧失,检查显示黄斑感光细胞丧失,周边视网膜明显正常。经过8年的随访,萎缩的中心区域扩大,并观察到周围的变化。