泛素特异性蛋白酶 5; USP5

异肽酶T;ISOT

HGNC 批准的基因符号:USP5

细胞遗传学位置:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:6,852,150-6,866,632(来自 NCBI)

▼ 说明

泛素(参见 191339)依赖性蛋白水解是一种复杂的蛋白质代谢途径,涉及多种细胞功能,例如染色质结构的维持、受体功能和异常蛋白质的降解。该过程的最后一步涉及将降解蛋白质上的多聚泛素链分解为泛素单体。 USP5 通过顺序外切机制从链的近端开始分解支链多聚泛素链(Wilkinson 等,1995)。

▼ 克隆与表达

威尔金森等人(1995) 纯化了 93 kD 牛蛋白,具有多聚泛素分解蛋白的预期特性。他们对这种酶进行了生物化学表征,并将其称为异肽酶 T(ISOT),并克隆了编码人类同源物的 cDNA(GenBank U35116)。推导的 835 个氨基酸的人类多肽的预测分子量为 93.3 kD。

安萨里-拉里等人(1996) 使用大规模鸟枪测序策略生成了人类 CD4 基因(186940) 及其在染色体 12 上的邻近区域的基因组序列。总共获得了117kb的基因组序列和大约11kb的cDNA序列。他们在该序列中鉴定出了 8 个基因,包括 CD4 和 ISOT。使用一系列策略,确定了基因的外显子/内含子边界、剪接变体和组织表达模式。组织表达分析表明,3.3 kb ISOT 转录物在大脑中高水平表达,而在心脏、肺、脾和骨骼肌中低水平表达。序列比较表明ISOT是泛素C末端羟化酶家族的成员。威尔金森等人(1995) 最初克隆了人类 ISOT,并报道该序列长 3,102 bp。安萨里-拉里等人(1996) 指出,他们的 cDNA 序列与 Wilkinson 等人报道的序列进行了比较(1995) 表明外显子 15 中存在选择性剪接。在 2 个序列之间发现了四个核苷酸差异,导致 lys-to-arg 和 gly-to-asp 取代。 cDNA 和基因组序列完全一致。

雷耶斯-图尔库等人(2006) 指出 835 个氨基酸的人 USP5 蛋白含有 4 个假定的泛素结合结构域:N 端锌指泛素结合结构域(ZNF-UBP)、由非连续的泛素特异性加工蛋白酶(UBP) 结构域包含活性位点 cys 和 his box 的区域,以及 2 个泛素相关结构域(UBA1 和 UBA2)。 UBA1和UBA2位于cys和his框之间,分别位于USP5的中央和C端区域。

▼ 生化特征

雷耶斯-图尔库等人(2006) 以 2.09 埃的分辨率报道了单独的 USP5 以及与泛素复合的 ZNF-UBP 结构域的晶体结构。他们发现,与其他泛素结合结构域不同,ZNF-UBP结构域包含一个深结合袋,泛素的C端二甘氨酸基序插入其中,从而解释了USP5对近端子单元上未修饰的C端的特异性。多聚泛素。突变分析表明 ZNF-UBP 结构域是 USP5 最佳催化激活所必需的。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Ansari-Lari 等人(1996) 将 USP5 基因定位到染色体 12p13,靠近 CD4 基因(186940)。