长压力诱导的非编码转录 5； LSINCT5

HGNC 批准的基因符号：LSINCT5

细胞遗传学位置：5p15.33 基因组坐标（GRCh38）：5:2,712,591-2,715,237（来自 NCBI）

▼ 说明

LSINCT5 被归类为长非编码 RNA（lncRNA），因为它包含 200 多个核苷酸并且缺少 ORF。此类RNA通常具有调节功能（Silva等人，2011）。

▼ 克隆与表达

Silva等人使用基因组平铺阵列来识别暴露于DNA损伤性烟草致癌物的正常人支气管上皮（NHBE）细胞中上调的非编码序列，然后是5-prime和3-prime RACE（2011） 确定了 LSINCT5。 2,647 个核苷酸的转录物包含 2 个 LINE 元件，并且是聚腺苷酸化的。 PCR分析在所有11个人体组织中检测到LSINCT5，其中在肾脏、胰腺、结肠和脾中表达最高，在脑、前列腺、胆囊和卵巢中表达最低。 Northern 印迹分析在 NHBE 细胞中检测到大约 3 kb 的 LSINCT5 转录物。定量 RT-PCR 检测到乳腺癌细胞核部分中 LSINCT5 含量增加。

▼ 基因功能

Silva 等人使用 Northern blot 分析（2011） 发现与正常乳腺上皮细胞系相比，乳腺癌细胞系中 LSINCT5 显着过度表达。 LSINCT5 表达的敲低可降低人乳腺癌和卵巢癌细胞的增殖。微阵列分析显示，LSINCT5 的敲低改变了涉及核组装、膜转移、基因表达、蛋白质磷酸化、运动和 T 细胞分化的数百个基因的表达。抑制剂研究表明 LSINCT5 由 RNA 聚合酶 III 转录（参见 614258）。

▼ 基因结构

席尔瓦等人（2011）确定LSINCT5是一个单外显子基因。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Silva 等人（2011） 将 LSINCT5 基因对应到染色体 5p15.33。