真核转录起始因子 3, 子单元 F; EIF3F

EIF3-p47
真核起始因子 3，亚基 5，前； EIF3S5，前

HGNC 批准的基因符号：EIF3F

细胞遗传学位置：11p15.4 基因组坐标（GRCh38）：11:7,987,337-8,001,852（来自 NCBI）

▼ 说明

真核起始因子 3（eIF3）是最大的 eIF，由至少 10 个不同的亚基组成，包括哺乳动物中的 p47（EIF3F）（Asano 等，1997）。有关 eIF3 的更多背景信息，请参阅第 66 页（EIF3S7；603915）。

▼ 克隆与表达

通过使用兔 p66、p47 和 p40（603912）的部分蛋白质序列搜索 EST 数据库，Asano 等人（1997）鉴定了编码人类同源物的 cDNA。尽管预测的 357 个氨基酸的人 p47 蛋白的计算分子量为 37.5 kD，但通过 SDS-PAGE 其迁移速度为 47 kD。作者将异常迁移归因于 p47 N 末端区域的高脯氨酸含量。序列分析显示，p40 和 p47 的 N 端半部彼此相似，并且与小鼠 Mov34 蛋白（157970）相关。 Northern 印迹分析显示 p47 在 HeLa 细胞中表达为 1.3 kb mRNA。

▼ 测绘

Hartz（2012）根据 EIF3F 序列（GenBank BC000490）与基因组序列（GRCh37）的比对，将 EIF3F 基因对应到染色体 11p15.4。

▼ 分子遗传学

Martin 等人在来自 7 个不相关的欧洲血统家庭的 9 名患有智力发育障碍的患者中，他们参与了破译发育障碍（DDD）研究（2018）在 EIF3F（F232V; 603914.0001）中检测到 phe232 与 val 变体的纯合性。该变体 rs141976414 是该基因中最常见的蛋白质改变变体之一，在非芬兰欧洲人中以 0.12% 的等位基因频率存在于 gnomAD 中，从未出现纯合性。

Huffmeier 等人在通过 GeneMatcher 和内部沟通发现的来自 16 个 MRT67 家庭的 21 名新报告患者中（2021）在 20 名患者的纯合性和复合杂合性中鉴定了先前报道的 EIF3F 基因中的 F232V 突变，并在 1 中具有新的 1-bp 重复（c.861dup, 603914.0002）。单倍型分析表明，F232V 变体位于相同的位置所有测试家庭中 15 名受影响个体的单倍型，表明存在创始人效应。与具有 F232V 变异纯合性的患者相比，具有 c.861dup 突变的患者（P3）的运动和言语发育以及出生后生长处于严重范围内，这表明基因型与表型相关的可能性。 gnomAD 数据库中不存在 c.861dup 变体。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 智力发育障碍，常染色体隐性遗传 67
EIF3F、PHE232VAL（rs141976414）

Martin 等人对来自 7 个不相关的欧洲家庭的 9 名患有智力发育障碍的患者（MRT67; 618295）进行了研究（2018）发现 EIF3F 基因中 c.694T-C 转变的纯合性导致密码子 232（F232V）中苯丙氨酸替换为缬氨酸。这种变体 rs141976414 在 gnomAD 的非芬兰欧洲人中出现的频率为 0.12%，但没有纯合子的报道。 232 位的苯丙氨酸在进化上是保守的，预计可以稳定蛋白质。蛋白质印迹显示，相对于杂合子和野生型 iPSC，纯合子细胞中的 EIF3F 蛋白水平低 27%。统计率和细胞增殖率均降低，但活力不降低。

Huffmeier 等人在来自 16 个家庭的 21 名新报告的 MRT67 患者中（2021）在 EIF3F 基因中发现了 c.694T-C 转变（c.694T-C，NM_003754），导致 F232V 替换。该突变在 20 名患者中发现为纯合状态，在 1 名患者中发现为具有 1 bp 重复的复合杂合状态（c.861dup，603914.0002）。单倍型分析表明，F232V 变体在所有测试家族的 15 名受影响个体中具有相同的单倍型，这表明存在创始人效应。与 F232V 纯合子患者相比，携带 c.861dup 突变的患者（P3）的运动和言语发育以及出生后生长处于严重阶段。 gnomAD 数据库中不存在 c.861dup 变体。

.0002 智力发育障碍，常染色体隐性遗传 67
EIF3F、1-BP DUP、NT861

用于讨论 EIF3F 基因中的 1-bp 重复（c.861dup, NM_003754），导致移码和提前终止（Gln288AlafsTer14），该现象在患有常染色体隐性遗传智力发育障碍的患者（P3）的复合杂合状态中发现-67（MRT67；618295），作者：Huffmeier 等人（2021），参见 603914.0001。