微 RNA 17; MIR17

miRNA17
MIRN17
MIR17-5p
微 RNA 91; MIR91
miRNA91
MIRN91

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MIR17-3p,包含

HGNC 批准的基因符号:MIR17

细胞遗传学位置:13q31.3 基因组坐标(GRCh38):13:91,350,605-91,350,688(来自 NCBI)

文字

▼ 说明

MicroRNA(miRNA) 是在动物和植物中发现的系统发育广泛的 18 至 25 核苷酸 RNA。这些小 RNA 可以通过与其目标 mRNA 相互作用来调节基因水平的表达。 MIR17 前体分别从其 5-prime 和 3-prime 末端编码 2 个成熟 miRNA,miR17 和 miR17*(Lagos-Quintana 等,2001;Mourelatos 等,2002)。

▼ 克隆与表达

Lagos-Quintana 等人使用定向克隆程序从 HeLa 细胞总 RNA 中鉴定 20 至 23 核苷酸 RNA(2001) 克隆了 MIR17,他们将其称为 miRNA17(参见命名)。 MIR17 序列为 ACUGCAGUGAAGGCACUUGU。 Northern 印迹分析证实 HeLa 细胞中存在 MIR17* 表达。

莫雷拉托斯等人(2002) 鉴定出 MIR17,他们称之为 miRNA91,是存在于包含 EIF2C2(606229)、GEMIN3(606168) 和 GEMIN4(606969) 的大型 15S RNP 复合物中的至少 40 个 miRNA 之一。 MIR17 序列是 CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU。莫雷拉托斯等人(2002) 指出 MIR17 和 MIR17* 源自相同的前体。

太田等人(2004) 在 C13ORF25 基因(609415) 转录本 B 的 3-prime UTR 中鉴定出 5 个前体 microRNA 和 7 个成熟 microRNA,包括 MIR17 和 MIR17*。

他等人(2005) 和 O'Donnell 等人(2005) 将 MIR17 和 MIR17* 分别称为 miR17-5p 和 miR17-3p。

▼ 基因功能

奥唐纳等人(2005) 表明 c-Myc 激活人类染色体 13 上 6 个 miRNA 簇的表达。染色质免疫沉淀实验表明 c-Myc 直接与该基因座结合。转录因子 E2F1(189971) 是 c-Myc 的另一个靶标,可促进细胞周期进程。奥唐纳等人(2005) 发现 E2F1 的表达受到该簇中 2 个 miRNA 的负调控,即 miR17-5p 和 miR20a(609420)。奥唐纳等人(2005) 得出的结论是,他们的发现扩展了 c-Myc 靶基因网络内已知的转录本类别,并揭示了 c-Myc 同时激活 E2F1 转录并限制其转录的机制,从而允许严格控制的增殖信号。

皮克林等人(2009) 发现通过互补寡核苷酸敲低正常人成纤维细胞中的成熟 miR17 和 miR20A 会导致 E2F1 过早积累,从而导致 DNA 双链断裂的积累、G1 检查点的激活和细胞生长的抑制。他们得出的结论是,miR17 和 miR20A 在整个 G1 期间维持较低的 E2F1 水平,直到 G1/S 边界处可以耐受 E2F1 水平升高。

Inomata 等人使用针对 MIR17 和 MIR20A 的表达谱和反义寡核苷酸(2009) 发现 CDKN1A(116899) 可能是人类 B 细胞淋巴瘤发生过程中 MIR17-92 的重要靶标。

单等人(2009) 开发了一系列过度表达 pre-miR17 的转基因小鼠。转基因小鼠的获得频率低于预期的孟德尔频率,但它们似乎具有正常的寿命。转基因小鼠过度表达 miR17-5p 和 miR17-3p,并表现出整体生长迟缓、器官变小以及造血细胞谱系大大减少。 miR17 靶标纤连蛋白(FN1; 135600) 和含有纤连蛋白结构域的蛋白 Fndc3a(615794) 的表达在体外和转基因小鼠中受到极大抑制。用 miR17 转染培养的人类和啮齿动物细胞系会导致细胞脱离、细胞粘附减少并抑制细胞迁移。 miR17 和纤连蛋白的表达呈负相关,在报告基因检测中,miR17 升高会降低 Fn1 和 Fndc3a 活性。单等人(2009) 得出的结论是,在过度表达 pre-miR17 的小鼠中观察到的生长缺陷至少部分是由于纤连蛋白表达减少所致。

特兰等人(2010) 发现胚胎 Bicc1(614295) -/- 小鼠两侧出现严重的多囊肾,以及肝脏和胰腺囊肿以及左右图案缺陷。定量 PCR 显示,与野生型肾脏相比,Bicc1 -/- 肾脏在胚胎第 15.5 天至 18.5 天期间,Pkd2(173910) 的表达逐渐下调,但 Pkd1(601313) 或 Pkhd1(606702) 的表达没有逐渐下调。在 Bicc1 +/- 小鼠肾脏中以及在非洲爪蟾幼虫中吗啉介导的 Bicc1 敲除后,Pkd2 表达也低于正常值。对 Pkd2 转录本的 3-prime UTR 的检查揭示了 miRNA Mir17 家族的靶位点。在爪蟾幼虫中 Bicc1 敲低后,Mir17 结合位点内的突变逆转了 Pkd2 的下调。此外,Mir17 双链体的表达减少了 Pkd2 3-prime UTR 报告基因的表达,而 Bicc1 的表达增加了 Pkd2 的表达。特兰等人(2010) 得出结论,BICC1 通过对抗 MIR17 的抑制作用来调节 PKD2 的表达。

厄普顿等人(2012) 发现持续的 IRE1-α(604033) RNase 激活会导致通常抑制 半胱天冬酶-2(600639) mRNA 转录的特定 microRNA(miR17;miR34a, 611172;miR96, 611606;和 miR125b, 610105)快速衰减,并且因此,线粒体凋亡途径的这种起始蛋白酶的蛋白质水平急剧升高。在无细胞系统中,重组 IRE1-α 在不同于 DICER(606241) 的位点对 microRNA 前体进行核酸内切。因此,厄普顿等人(2012) 得出结论,IRE1-α 通过终止 microRNA 生物发生来调节促凋亡蛋白,非编码 RNA 是内质网(ER) 应激反应的一部分。

Shen 等人利用生物信息学分析(2009) 将 BRCA1(113705) 鉴定为可能的 MIR17 靶转录本。将 MIR17 转染至 MCF-7 乳腺癌细胞中,可减少共表达 BRCA1 报告基因的表达。

MI17、MIR20A(609420) 和 MIR92A1(609422) 包含在染色体 13 上的 miRNA 簇内,转录为多顺反子单元(参见 MIR17HG,609415)。该簇与包含 MIR106A(300792) 和 MIR92A2(301092) 的染色体 X 上的簇以及包含 MIR106B(612983) 和 MIR25(612150) 的染色体 7 上的另一个簇高度同源。 Fontana 等人使用多种生物信息学工具(2007) 发现 AML1(151385)(一种参与骨髓和单核细胞分化的基因)可能是 MIR17-5p、MIR20A 和 MIR106A 的靶标。敲低、过表达和结合研究证实,AML1 是这些 miRNA 的直接靶标,对 AML1 靶基因 MCSFR(CSF1R;164770)和单核细胞生成具有下游影响。此外,AML1 结合 MIR17-MIR20A-MIR92A 和 MIR106A-MIR92B 簇的启动子区域,表明存在负反馈环。

▼ 分子遗传学

沉等人(2009) 在 MIR17 初级转录本中发现了一个 C 到 T 多态性,预计它会改变次级茎环结构,但不会改变成熟的 MIR17 序列。两个等位基因在 MCF-7 细胞中的表达表明,包含 C 等位基因的转录物比包含 T 等位基因的转录物加工更有效,并产生更成熟的 MIR17。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Lagos-Quintana 等人(2001) 和 Mourelatos 等人(2002) 将 MIR17 基因对应到染色体 13。Ota 等人使用 FISH 和基因组序列分析(2004) 将包含 MIR17 的 C13ORF25 基因对应到染色体 13q31.3。

丰塔纳等人(2007) 指出,第 13 号染色体上包含 MIR17、MIR18A(609417) 和 MIR92(参见 MIR92A1, 609415) 的 miRNA 基因簇与第 7 号染色体上包含 MIR106B 和 MIR25 的 miRNA 基因簇以及包含 MIR106B 和 MIR25 的染色体 X 上的另一个簇高度同源。 MIR106A 和 MIR92(MIR92A2)。

▼ 命名法

Mourelatos 等人最初克隆了从 miR17 前体 5-prime 末端产生的成熟 miRNA,即 miR17-5p(2002),他将其称为 miRNA91。 Lagos-Quintana 等人最初克隆了从 miR17 前体 3-prime 末端产生的成熟 miRNA,miR17-3p(2001),他将其称为 miRNA17。基于 Landgraf 等人的数据(2007) 表明 miR17-5p 是由 miR17 前体产生的主要 miRNA,miR17-5p 和 miR17-3p 分别更名为 MIR17 和 MIR17*。