角质细胞分化相关蛋白; KRTDAP
KDAP
HGNC 批准的基因符号:KRTDAP
细胞遗传学位置:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:35,487,324-35,490,464(来自 NCBI)
▼ 说明
KRTDAP 预计在角质形成细胞终末分化中发挥作用(Leclerc et al., 2014)。
▼ 克隆与表达
来自胚胎大鼠表皮,Oomizu 等人(2000) 克隆了全长大鼠 Krtdap,他们将其称为 Kdap,并通过数据库分析鉴定了 3 个额外的剪接变体。他们还鉴定了小鼠和人类 KDAP,预计它们也有 4 个剪接变体。推导的 98 个氨基酸全长大鼠蛋白的计算分子量为 11 kD,具有保守的 N 末端信号序列和 2 个推定的 N-肉豆蔻酰化位点。 RT-PCR 在分化的胚胎表皮和成年大鼠的复层和假复层上皮中检测到 4 个 Kdap 剪接变异体。大鼠皮肤原位杂交将 Kdap 定位于表皮基底上层和毛囊漏斗部的基底上层细胞。
Matsui 等人使用定量 RT-PCR(2004) 在几个小鼠组织的复层上皮以及气管、膀胱和胸腺中检测到 Kdap。在典型的单层上皮细胞中检测不到 Kdap。小鼠足垫的原位杂交检测到Kdap表达仅限于棘层的基底上部分。表位标记的人 KDAP 在 293/EBNA-1 细胞中表达后进行 N 末端加工和分泌。
▼ 基因功能
勒克莱尔等人(2014) 发现,在 dermokine(DMKN; 617211)-β 和 -γ 剪接变体纯合无效的新生小鼠皮肤中,Krtdap 和 suprabasin(SBSN; 609969) 的表达增加。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,松井等人(2004) 将 KRTDAP 基因定位到染色体 19q13.1,它与角蛋白相关基因 DMKN 和 SUPERBASIN 串联。他们将小鼠 Krtdap 基因定位到染色体 7A3-B1 的一个区域,该区域与人类染色体 19q13.1 具有同源性。