LSM14A mRNA 加工体组装因子; LSM14A

RNA 相关蛋白 55; RAP55

HGNC 批准的基因符号:LSM14A

细胞遗传学位置:19q13.11 基因组坐标(GRCh38):19:34,172,504-34,229,288(来自 NCBI)

▼ 说明

基于与 Sm 蛋白家族的序列同源性,在多种生物体中鉴定出 Sm 样蛋白(参见 SNRPD2, 601061)。 Sm 样蛋白含有 Sm 序列基序,该基序由 2 个区域组成,该区域由折叠为环的可变长度接头分隔开。 Sm 样蛋白被认为形成存在于 tri-snRNP 颗粒中的稳定异聚体,这对于前 mRNA 剪接很重要。

▼ 克隆与表达

P-体是离散的细胞质结构,含有参与 mRNA 降解的酶,并与 RNAi 介导的转录后基因沉默有关。 Yang 等人对人类 HEP2 细胞进行了免疫荧光和免疫印迹分析(2006) 表明原发性胆汁性肝硬化(PBC; 109720) 患者血清中的抗体与 P 体中存在的 60-kD 蛋白质有反应。使用 PBC 血清进行人 cDNA 表达文库筛选,鉴定出该蛋白为 RNA 相关蛋白 55-kD(RAP55),也称为 LSM14A。 LSM14A 编码 463 个氨基酸的蛋白质,预计分子量为 50.5 kD,包含 N 端 LSM 结构域和 C 端 FDF 基序侧翼的 2 个富含 RGG 的结构域。含有 LSM 结构域的蛋白质包含 RNA 结合蛋白家族(参见 607281);富含 RGG 的结构域存在于 RNA 结合蛋白中,包括人 HNRNPU(602869)、原纤维蛋白(134795) 和核仁素(164035),并且 FDF 基序已被提议与 RNA 或 RNP 复合体成员相互作用。用 LSM14A 对 HEP2 细胞进行一系列转染表明,LSM14A 定位于 P 体,并且该定位需要 RGG 结构域和 FDF 基序。数据库搜索显示,LSM14A 同源物存在于线虫、果蝇、侧蝾螈和爪蟾中。 Unigene 的检查显示在所有发育阶段几乎普遍存在 LSM14A 表达,免疫组织化学显示 LSM14A 在人类细胞系中表达,包括淋巴细胞、单核细胞、Hep2、A549、Be2C 和 U2OS 细胞。

▼ 基因功能

Yang 等人使用 LSM14A 转染的 Hep2 细胞(2006) 表明,LSM14A 在亚砷酸盐诱导的氧化应激过程中靶向应激颗粒,并且 C 端 RGG 结构域对于这种靶向是必要且充分的。 siRNA 下调 Hep2 细胞中的 LSM14A 导致 P 体丢失。