CBY1-相互作用条带结构域蛋白1; CIBAR1
具有序列相似性的家族 92,成员 A; FAM92A
FAM92A1
HGNC 批准的基因符号:CIBAR1
细胞遗传学位置:8q22.1 基因组坐标(GRCh38):8:93,700,550-93,731,527(来自 NCBI)
▼ 说明
含有 Bin/amphiphyn(600418)/Rvs(BAR) 结构域的蛋白质(例如 FAM92A)预计会以同二聚体和异二聚体形式结合脂质膜并产生膜曲率。 BAR 结构域蛋白在内吞作用、囊泡分裂和融合以及肌动蛋白细胞骨架的调节中发挥作用(Li 等人总结,2016)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析和人类细胞系的 RT-PCR,Ruan 等人(2007) 鉴定了 FAM92A1 的 9 个剪接变体。他们克隆了 3 个剪接变体,编码 251、271 和 289 个氨基酸的蛋白质。这 3 种蛋白质均具有 N 端肉豆蔻酰化位点、中央卷曲螺旋 BAR 样结构域和许多磷酸化位点。
Li 等人使用串联亲和纯化和质谱法鉴定 HEK293 细胞中纤毛蛋白 CBY1(607757) 的结合伴侣(2016) 鉴定了 FAM92A 和 FAM92B(617274)。推导的 289 个氨基酸的 FAM92A 蛋白主要由 BAR 结构域组成,计算分子量为 33 kD。数据库分析表明 FAM92A 表达无处不在。表位标记的 FAM92A 和 FAM92B 与 CBY1 共定位于人视网膜色素上皮细胞和多纤毛气管上皮细胞的初级纤毛基部。 FAM92蛋白也显示出点状囊泡分布。内源 FAM92A 也定位于母中心粒的远端。数据库分析揭示了 FAM92A 在脊椎动物和大多数独角兽生物体中的直系同源物,但在双节动物中却没有。
Schrauwen 等人在胚胎第(E) 11.5 天对小鼠进行免疫染色(2018) 观察到 Fam92a 在整个发育中的肢芽中都有强烈的表达,包括进展区和顶端外胚层脊,并且在纤毛中具有强烈的定位。从E11.5到E15.5的小鼠胚胎中表现出高且稳定的表达。 E21 时大鼠前肢的免疫染色显示 Fam92a 在皮肤的多层中强烈表达,包括角质层、颗粒层和基底层,以及软骨细胞和间质组织。
▼ 基因结构
阮等人(2007)确定FAM92A基因有12个外显子,加上至少4个替代外显子2和2个替代外显子3。外显子1是非编码的,ATG密码子存在于替代外显子2b、2e、3和3a中,以及终止密码子存在于外显子 3a、9 和 12 中。
▼ 测绘
阮等人(2007) 报道 FAM92A 基因对应到染色体 8q22.1。
▼ 基因功能
通过转染 HeLa 细胞,Ruan 等人(2007) 发现编码 251、271 和 289 个氨基酸蛋白的 FAM92A1 变体的过度表达会不同程度地阻断 G2 期进入并引发细胞凋亡。
Li 等人在转染的人 HEK293 细胞中使用免疫沉淀分析(2016) 发现 CBY1 与 FAM92A 和 FAM92B 相互作用。突变分析表明,CBY1 的 N 端区域和 C 端卷曲螺旋基序均与 FAM92 蛋白的 BAR 结构域相互作用。敲低研究表明 FAM92 蛋白和 CYB1 至少部分地相互稳定。 FAM92A 与 CYB1 的共表达诱导大的球状膜的形成,而 FAM92B 与 CYB1 的共表达诱导膜管状结构的形成。两种膜结构均含有 RAB8(参见 RAB8A,165040)。李等人(2016) 提出,FAM92 蛋白与 CBY1 合作,在纤毛发生的早期阶段招募和融合远端附属物的内体囊泡。
▼ 分子遗传学
Schrauwen 等人在 3 名患有 A9 型轴后多指畸形(PAPA9; 618219) 的巴基斯坦兄弟中(2018) 鉴定了 FAM92A 基因(R160X; 617273.0001) 中的无义突变的纯合性,该突变与疾病分离,并且在 186 名巴基斯坦对照中未发现该突变。
▼ 动物模型
施劳文等人(2018) 生成了 Fam92a -/- 小鼠,并观察到肱骨三角肌结节上有额外的骨骼生长或外生骨疣,与肌腱钙化一致。与对照组相比,突变小鼠的手指形态异常明显增多,包括多指畸形和骨瘤。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 多趾,后轴,A9 型(1 个家族)
CIBAR1,ARG160TER(rs368652620)
Schrauwen 等人在 3 名患有 A9 型轴后多指畸形(PAPA9; 618219) 的巴基斯坦兄弟中(2018) 鉴定了 FAM92A 基因中 c.478C-T 转换(c.478C-T, NM_001283034.1) 的纯合性,导致 BAR 结构域内的 arg160 到 ter(R160X) 取代。他们未受影响的父母和未受影响的兄弟是该突变的杂合子,在 186 个巴基斯坦内部对照 DNA 样本或大中东 Variome 项目数据库中均未发现这种突变。然而,该变体在gnomAD数据库中的出现频率较低(所有人群MAF,2.04 x 10(-5);东南亚人MAF,6.55 x 10(-5))。在转染的 COS-7 细胞中进行的实验表明,FAM92A 同二聚化和 FAM92A/Chibby1(CBY; 607757) 复合物均被突变蛋白破坏。此外,与野生型 FAM92A 相比,R160X 突变体在纤毛基部的 FAM92A 募集和与 Chybby1 的共定位受到损害。