环指蛋白 169; RNF169

KIAA1991

HGNC 批准的基因符号：RNF169

细胞遗传学位置：11q13.4 基因组坐标（GRCh38）：11:74,748,849-74,842,413（来自 NCBI）

▼ 说明

RNF169 是泛素依赖性双链断裂（DSB） 反应的负调节因子（Poulsen et al., 2012; Chen et al., 2012）。

▼ 克隆与表达

波尔森等人（2012） 表明，708 个氨基酸的人 RNF169 蛋白含有 N 端环指基序和 C 端“与泛素相互作用的基序”（MIU） 域。

陈等人（2012） 报道人类 RNF169 除了 C 端 MIU 结构域（MIU2） 之外还包含中央 MIU 结构域（MIU1）。

▼ 测绘

Gross（2019） 根据 RNF169 序列（GenBank BC169205） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 RNF169 基因对应到染色体 11q13.4。

▼ 基因功能

波尔森等人（2012） 发现 GFP 标记的人 RNF169 广泛定位于 U2OS 细胞的核质，但在暴露于 DSB 诱导剂后变得集中在 DSB 位点。敲低实验表明，RNF169 在 RNF8（611685）/RNF168（612688） 下游发挥作用。突变分析表明，RNF169 的 C 端 MIU 结构域可识别 DSB 修复灶中由 RNF168 介导的泛素化直接修饰的结构。 RNF169 也与未受损的染色质相关，但这种关联并不涉及 MIU 结构域对 RNF8/RNF168 依赖性泛素化的识别。泛素依赖性蛋白招募到 DSB 位点不需要 RNF169。相反，RNF169 通过与 DSB 修复因子 53BP1（TP53BP1；605230）和 RAP80（UIMC1；609433）竞争来调节 DSB 修复途径的利用，从而延迟和限制它们与 DSB 处泛素修饰的染色质的关联。

Chen 等人使用免疫染色和突变分析（2012） 孤立地将 RNF169 鉴定为 DNA 损伤响应因子，它以依赖于其 MIU2 结构域的方式定位于 293T 细胞核中的 DNA 损伤位点。 RNF169 与泛素相互作用，并以 RNF8 和 RNF168 依赖性方式重新分布到 DSB。 RNF169 与 RNF168 竞争泛素并扰乱 RNF168 在 DNA 损伤位点的定位，从而限制 53BP1 在 DSB 的积累。 RNF169 的耗尽导致持续的 DNA 损伤信号传导和 G2/M 检查点的长时间停滞。相比之下，RNF169 的异位表达促进细胞在 DNA 损伤恢复后进入有丝分裂，表明 RNF169 充当泛素依赖性 DNA 损伤信号级联的负调节因子。

安等人（2018） 发现人类 RNF169 和 53BP1 占据 DSB 周围的不同结构域，并沿着受损染色质结构域表现出不同的分布。 RNF169 优先在与 RAD51（179617） 结合的 DSB 处积累，并促进其 HR 修复。除了 RNF8/RNF168 介导的泛素化途径外，CTIP 还促进了 RNF169 在 DSB 侧翼染色质处的积累（RBBP8；604124）。 DSB 近端区域 RNF169 的富集促进了 DSB 的切除和同源定向修复。具体来说，RNF169 通过拮抗 53BP1 和/或 RAP80 以剂量依赖性方式调节单链退火（SSA） 修复，尤其是在 HR 缺陷的细胞中。作者还表明，RAP80 沿着 DSB 两侧的染色质结构域表现出与 RNF169 相似的分布模式。

▼ 生化特征

基特夫斯基-勒布朗等人（2017） 发现人类 RNF169 响应 DNA 损伤，识别核小体核心颗粒（NCP） 中 RNF168 在 lys13 或 lys15 处组蛋白 H2A（参见 613499）的泛素化。溶液NMR分析表明RNF169的MIU2结构域与泛素的疏水表面以低亲和力相互作用。 NCP 的存在通过 NCP 上的核小体酸性斑块与 RNF169 富含精氨酸的区域之间的 2 个额外接触，将 RNF169-泛素相互作用增加了约 40 倍。突变分析确定RNF169的arg689和leu699/arg700是形成复合物的关键残基。计算模型验证了 RNF169 对 lys13/lys15 泛素化 H2A-NCP 选择性识别的三管齐下相互作用。