SPIB转录因子; SPIB
HGNC 批准的基因符号:SPIB
细胞遗传学位置:19q13.33 基因组坐标(GRCh38):19:50,418,938-50,431,314(来自 NCBI)
▼ 说明
SPI1(165170) 和 SPIB 是 ETS 转录因子亚家族的成员(参见 ETS1;164720)。 ETS 蛋白共享一个保守的 ETS 结构域,可介导特定的 DNA 结合。 SPIB 和 SPI1 与富含嘌呤的序列 PU 框(5-prime-GAGGAA-3-prime) 结合。
▼ 克隆与表达
Ray 等人通过使用与 SPI1 DNA 结合区域相对应的 cDNA 探针筛选伯基特淋巴瘤 cDNA 文库(1992)分离出编码SPIB的cDNA。推导的 262 个氨基酸蛋白与 SPI1 具有 43% 的相同性。它具有与 SPI1 67% 相同的碱性 C 末端,以及富含脯氨酸的酸性 N 末端结构域。凝胶阻滞和竞争结合分析证实 SPIB 与 PU 框相互作用。记者分析表明,SPIB 编码 PU 框特异性转录激活剂。 Northern 印迹分析揭示了 B 淋巴细胞系中主要 1.5-kb 转录物以及次要 2.8-和 3.7-kb 转录物的表达,而早幼粒细胞和单核细胞系中表达较低。小鼠组织中的表达主要限于脾脏和胸腺。
雷-加勒特等人(1996) 鉴定了一种 177 个氨基酸的 SPIB 剪接变体,其 N 端 162 个残基与 SPIB 相同。然而,该变体缺乏 C 端含有 ETS 的 DNA 结合结构域。 Northern 印迹分析表明该变体由 2.8 kb 转录本编码。 RT-PCR 分析检测到 B 细胞系和原代 B 细胞中该变体的表达量占全长转录物的 10%。蛋白质印迹分析显示 40-kD 截短亚型的细胞质表达以及 46-kD 全长蛋白的细胞核和细胞质表达;两个质量分别高于预测大小 18 和 28 kD。
▼ 基因结构
雷-加勒特等人(1996) 确定 SPIB 基因至少包含 6 个跨度超过 20 kb 的外显子。内含子 5 跨度 10 kb,DNA 结合域由外显子 6 编码。
▼ 测绘
Ray 等人使用原位杂交(1992) 将 SPIB 基因定位到染色体 19q13.3-q13.4。