核仁蛋白 6; NOL6
核仁 RNA 相关蛋白; NRAP
UTP22,酿酒酵母,同源物; UTP22
HGNC 批准的基因符号:NOL6
细胞遗传学位置:9p13.3 基因组坐标(GRCh38):9:33,461,353-33,473,924(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Utama 等人通过使用部分 Nol6 克隆筛选小鼠胚胎干细胞 cDNA 文库,然后进行 5-prime RACE、数据库分析和人肝细胞系 RNA 的 RT-PCR(2002) 克隆了全长人类和小鼠 NOL6,他们将其称为 NRAP。他们鉴定出 NOL6-α、-β 和 -γ 亚型分别包含 1,146、1,007 和 699 个氨基酸。 NOL6-α 与小鼠 Nol6-α 具有 88% 的氨基酸同一性。人和小鼠编码区都富含 GC,并且与 Poly(A) 聚合酶(605553) 中的 PAP/25A 核心结构域具有弱同源性。 NOL6 含有潜在的核定位信号并具有多个潜在的磷酸化位点。免疫组织化学和免疫荧光研究将 Nol6 表达定位于多种啮齿动物细胞系的核仁内,尽管表达并未特异性定位于 rRNA 转录位点。 Nol6 在有丝分裂过程中定位于浓缩染色体,其模式类似于 B23/核磷蛋白(NPM1;164040)。小鼠胚胎的原位杂交研究表明,Nol6 在发育过程中普遍表达。对小鼠组织的免疫印迹研究发现,在脾、睾丸、结肠、肾、胃和脑中强表达,在肺、肝和小肠中中等表达,在心脏和骨骼肌中低表达。
通过数据库分析,伯恩斯坦等人(2004) 将 NOL6 鉴定为酵母 Utp22 的人类直系同源物。 Utp22 是 18S rRNA 生物合成所需的酵母核糖核蛋白的组成部分。
▼ 基因功能
乌塔玛等人(2002) 表明放线菌素 D 和 RNase 处理都会破坏 Nol6 核仁定位,而环己酰胺则没有效果。他们认为 Nol6 与前 rRNA 转录物直接或间接相互作用。
▼ 基因结构
乌塔玛等人(2002) 确定 NOL6 基因包含 26 个外显子,跨度为 11.4 kb。选择性剪接排除了 NOL6-β 中的外显子 24 和 25,并跳过了 NOL6-γ 同工型中的外显子 16 至 25。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Utama 等人(2002) 将 NOL6 基因定位到染色体 9p13。