旋转畸形; RTTN

HGNC 批准的基因符号:RTTN

细胞遗传学位置:18q22.2 基因组坐标(GRCh38):18:70,003,031-70,205,687(来自 NCBI)

▼ 说明

RTTN 是左右(L-R) 规范和轴向旋转的早期发育过程所必需的,并且可能在脊索发育中发挥作用(Faisst et al., 2002)。

▼ 克隆与表达

Faisst等人通过对小鼠胚胎干细胞进行大规模基因陷阱筛选来鉴定L-R规范突变体,然后进行数据库分析、5-prime RACE以及筛选胚胎小鼠cDNA文库(2002)分离了小鼠 Rttn。推导的 1595 个氨基酸的小鼠 Rttn 蛋白的计算分子量为 178.2 kD,并包含 3 个预测的跨膜结构域。 Northern 印迹分析在小鼠胚胎中检测到 6.5 kb 的转录物。 Faisst 等人使用杂合 Rttn 突变体小鼠胚胎和野生型胚胎的整体原位杂交(2002)显示Rttn从胚胎第(E)7.5天开始一直表达到胚胎发育。到 E8.5,在端脑和中胚层(尤其是体节)和脊索中检测到 Rttn 表达。到 E9.5,Rttn 在体节中的表达持续存在,并在前肢芽、基底前脑、第一鳃弓中额外表达,但在发育中的心脏中不表达。费斯特等人(2002) 在 E11.5 和 E12.5 检测到心脏原基中的 Rttn 表达,以及鳃弓中的表达增加。

赫拉德曼·KIAA等人(2012) 发现 RTTN 与人成纤维细胞初级纤毛的基体共定位。成纤维细胞中 RTTN 的敲低导致具有多个基体的纤毛异常短,表明旋转蛋白参与正常纤毛结构的维持。体外研究表明 RTTN 参与神经元细胞中 BMP4(112262) 信号传导的调节。在胚胎小鼠大脑中,旋转蛋白定位于上皮层和发育中小鼠皮层的边缘区,具有从后到前的梯度,类似于迁移的 Cajal-Retzius 神经元。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Faisst 等人(2002) 将 Rttn 基因定位到小鼠染色体 18 的端粒附近,该基因与人类染色体 18q 同源。

Hartz(2012) 根据 RTTN 序列(GenBank BC046222) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 RTTN 基因对应到染色体 18q22.2。

▼ 分子遗传学

Kheradmand Kia 等人发现,土耳其近亲家庭的 3 名成员患有小头畸形、身材矮小和多小脑回症并伴有癫痫发作(MSSP; 614833),导致中度至重度智力低下(2012) 鉴定出 RTTN 基因(610436.0001) 中的纯合突变。通过自合性作图和候选基因测序来鉴定突变。一名患有类似疾病的无关患者携带不同的纯合突变(610436.0002)。多小脑回主要是迁移后皮质组织缺陷,与小鼠胚胎脑中旋转蛋白定位于边缘区一致。研究结果支持旋转蛋白参与这种皮质畸形的发病机制,并表明异常的睫状体功能导致人类皮质的异常发育和组织。

Shamseldin 等人在 3 个患有小头畸形、身材矮小和多小脑回症的不相关家庭的受影响成员中(2015) 鉴定了 RTTN 基因(610436.0003-610436.0006) 中的纯合或复合杂合突变。

Grandone 等人是一对兄弟姐妹,其父母是摩洛哥人,患有 MSSP(2016) 在 RTTN 基因中发现了一个纯合错义突变(R985G; 610436.0007)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与该家族中的疾病分离,并且在 gnomAD 数据库中未发现。

Cavallin 等人发现一名患有 MSSP 的摩洛哥近亲父母所生男孩(2018) 鉴定了 RTTN 基因中 R985G 突变的纯合性。该突变是通过基于三重奏的全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。

Wambach 等人在一名患有 MSSP 的男婴中,其父母是摩洛哥近亲所生(2018) 鉴定了 RTTN 基因中的复合杂合突变:V64F(ExAC 数据库中不存在)和内含子变异(c.32-3C-T)(在 ExAC 数据库中以 0.0073 的频率存在)。父母均具有其中一种突变的杂合子。婴儿培养的成纤维细胞显示纤毛异常,初级纤毛的长度和数量减少。作者建议,初级纤毛长度和数量的功能特征可用于确定 RTTN 变异的致病性。

▼ 动物模型

费斯特等人(2002) 发现纯合 Rttn 突变体胚胎从胚胎第(E) 9.5 天开始表现出随机心脏循环、延迟神经管闭合和轴旋转失败。突变胚胎在 E10.5 时表现出强烈的规律心跳。到E11.5,突变胚胎显示出心管的左侧而不是右侧环状,并且心脏发育在环状心脏阶段停止。 E11.5 之后未检测到突变胚胎,表明该阶段附近胚胎致死。通过整体原位杂交,纯合子 Rttn 突变体胚胎表现出神经基因 Pax6(607108)、Wnt1(164820) 和 En1(131290) 以及参与体细胞分化的基因 Pax3 的表达减少以及表达域改变。 606597) 和 Dll1(606582)。费斯特等人(2002) 认为神经形成延迟、区域化分化改变和体节形态发生改变都会导致轴旋转失败。通过整体原位杂交,Shh(600725) 仅在脊索的尾半部显示表达,而涉及 L-R 规范的其他基因,如 Nodal(601265)、Lefty2(601877) 和 Pitx2(601542) 显示出双侧表达或与正常的不对称表达模式相比缺乏表达。 RT-PCR 分析检测到 Invs(243305) 或 L-R 动力蛋白(DNAH11; 603339) 的表达没有变化。

此前,查特吉等人(2007) 从小鼠的 CD-1 菌株中分离出一种隐性致死突变,他们称之为“无转向”(nt),因为胚胎未能进行胚胎翻转。突变胚胎还表现出心管循环缺陷,在循环心管阶段心脏发育停滞,以及心包积液和血液淤积,表明心力衰竭。 nt突变体还表现出尾部截短、脊索退化以及侧板中胚层中Nodal和Lefty的双侧异常或缺失表达。查特吉等人(2007) 确定 nt 是由染色体 18 中跨越 Rttn、Cd226(605397)、Dok6(611402) 和部分 Txndc10(TMX3; 616102) 的 1.6-Mb 缺失引起的。他们指出nt突变体的表型与Faisst等人报道的Rttn突变体的表型相同(2002),表明这很可能是由 Rttn 缺陷引起的。

▼ 等位基因变异体(7 个精选示例):

.0001 小头畸形、身材矮小和伴有癫痫发作的多小脑回症
RTTN,LEU932PHE

Kheradmand Kia 等人发现,土耳其近亲家庭的 3 名成员患有小头畸形、身材矮小和多小脑回症并伴有癫痫发作(MSSP; 614833),导致中度至重度智力低下(2012) 在 RTTN 基因的外显子 22 中发现了纯合 2796A-T 颠换,导致高度保守的残基处由 leu932 替换为 phe(L932F)。每个未受影响的父母都是杂合突变,而在 265 个对照个体中没有发现这种突变。突变体 L932F RTTN 正确定位于患者成纤维细胞的基体,但与对照相比,纤毛异常的比例较高,包括具有球状尖端的短纤毛。与对照成纤维细胞相比,患者成纤维细胞的基因表达谱显示,与大脑发育和/或已知在纤毛上受到调节的多个基因失调。此类基因包括 SHH(600725)、HHIP(606178)、WNT5A(164975) 和 BMP4(112262)。

.0002 小头畸形、身材矮小和伴有癫痫发作的多小脑回症
RTTN,CYS27TYR

Kheradmand Kia 等人发现,一名来自佛得角的近亲父母所生的 16 岁男孩患有多小脑回伴癫痫发作(614833),导致严重智力低下(2012) 在 RTTN 基因的外显子 2 中鉴定出纯合 80G-A 转换,导致第一个犰狳结构域中高度保守的残基处发生 cys27-to-tyr(C27Y) 取代。患者成纤维细胞没有表现出明显的纤毛结构或数量异常。尽管如此,与对照成纤维细胞相比,患者成纤维细胞的基因表达谱显示,与大脑发育和/或已知在纤毛上受到调节的几个基因失调。此类基因包括 SHH(600725)、HHIP(606178)、WNT5A(164975) 和 BMP4(112262)。

.0003 小头畸形、身材矮小和多小脑畸形
RTTN、IVS23DS、A-G、+8

Shamseldin 等人发现,也门血统近亲家庭的 3 名兄弟患有宫内生长迟缓、严重身材矮小、原发性小头畸形和严重智力障碍(MSSP; 614833)(2015) 在 RTTN 基因的内含子 23 中发现了纯合突变(c.2885+8A-G, NM_173630.3),导致提前终止密码子(S963X)。通过自合性作图和全外显子组测序来鉴定突变。 RT-PCR 证实该突变产生了一个隐蔽的剪接供体位点,从而导致内含子的插入 7 bp 的保留。该突变在家族中随疾病分离,并且在 1000 个基因组计划和 ExAC 数据库以及 650 个内部种族匹配的外显子组中不存在。

.0004 小头畸形、身材矮小和多小脑畸形
RTTN,LYS1064GLN

Shamseldin 等人发现,一名来自沙特阿拉伯的男性患者患有宫内生长迟缓、严重身材矮小、原发性小头畸形和严重智力障碍(MSSP; 614833)(2015) 鉴定出 RTTN 基因中的纯合 c.3190A-C 颠换(c.3190A-C,NM_173630.3),导致 lys1064 至 gln(L1064Q) 取代。 Lys1064 在人类中是不变的(正如千人基因组计划和 ExAC 数据库以及内部外显子组所揭示的那样),通过计算机分析预测其具有高致病性,并且在斑马鱼中也是保守的。桑格测序证实了指标个体的突变为纯合性,其父母和两个健康姐妹的突变为杂合性。

.0005 小头畸形、身材矮小和多小脑畸形
RTTN、ALA578PRO

Shamseldin 等人在加拿大一个患有宫内生长迟缓和原发性小头畸形家庭的 2 个兄弟中(MSSP; 614833)(2015) 鉴定了 RTTN 基因中的复合杂合突变:外显子 13 中的 c.1732G-C 颠换(c.1732G-C,NM_173630.3),导致 ala578 到 pro(A578P)的取代,以及 c外显子 43 中的 .5750A-G 转变,导致 asp1917 至甘氨酸(D1917G) 取代。计算机预测这两种突变都具有致病性。

.0006 小头畸形、身材矮小和多小脑畸形
RTTN,ASP1917GLY

讨论 RTTN 基因中的 c.5750A-G 转变(c.5750A-G,NM_173630.3),导致 asp1917 到 gly(D1917G) 取代,在 2 个兄弟的复合杂合状态中发现Shamseldin 等人提出的宫内生长迟缓和原发性小头畸形(MSSP; 614833)(2015),参见 610436.0005。

.0007 小头畸形、身材矮小和多小脑畸形
RTTN、ARG985GLY

Grandone 等人的一对兄妹,其父母都是摩洛哥人,患有小头畸形、身材矮小和多小脑回症(MSSP; 614833)(2016) 在 RTTN 基因的外显子 23 的倒数第二个碱基上鉴定出纯合的 T 到 C 转换(chr18.6,780,1710T-C, GRCh37),导致 arg985 到甘氨酸(R985G) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与该家族中的疾病分离,并且在 gnomAD 数据库中未发现。格兰多内等人(2016) 表明该突变还导致剪接异常,产生 2 种不同的 mRNA,一种跳过外显子 23,另一种跳过外显子 23 和 24,产生框外信使。

Cavallin 等人发现一名患有 MSSP 的摩洛哥近亲父母所生男孩(2018) 鉴定了 RTTN 基因中 R985G 突变的纯合性。该突变是通过基于三重奏的全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。