丙氨酸氨基转移酶,血浆水平,数量性状基因座 2
ALTQTL2
▼ 正文
有关血浆丙氨酸氨基转移酶水平数量性状基因座遗传异质性的讨论,请参见 ALTQTL1(612363)。
▼ 测绘
袁等人(2008) 对 3 个欧洲白人队列(总共 7,715 名个体)进行了血浆肝酶水平的全基因组关联研究,随后在 3,699 名英国印度裔亚洲个体和 1,005 名英国白人个体中进行了重复研究。在染色体 22q13.31 上鉴定出与血浆丙氨酸氨基转移酶(ALT 或 GPT;138200)水平相关的基因座,跨越 SAMM50(612058) 和 PNPLA3(609567) 基因。发现与 SNP rs2281135(p = 8.4 x 10(-16)) 和 rs2143571(p = 7.2 x 10(-9)) 存在显着连锁。
Kollerits 等人在 3 个孤立的西欧亚研究人群中,共有 4,290 名参与者(2010) 分析了 PNPLA3 基因中常见的 SNP rs738409,并测量了血清 ALT、天冬氨酸转氨酶(AST) 和 γ-谷氨酰转移酶(GGT) 水平。次要等位基因纯合导致 ALT 浓度显着增加 3.53 U/L(组合 p = 1.86 x 10(-9)),AST 浓度显着增加 2.07 U/L(组合 p = 9.58 x 10(-9)) 6))。 rs738409 还与非酒精性脂肪肝病(613282) 和酒精性肝病(参见 613282) 相关。科勒里茨等人(2010)提出PNPLA3可能是肝功能障碍的易感基因。
钱伯斯等人(2011) 对 61,089 名个体进行了一项全基因组关联研究,确定了 42 个与血浆中肝酶浓度相关的基因座。 ALT 最强的关联位于 22q13 与 rs738409,效应为 6.0%,95% CI 5.0-7.0,p = 1.2 x 10(-45)。该区域感兴趣的基因是 PNPLA3 和 SAMM50。