RAD54 同源物 B; RAD54B
RAD54,酿酒酵母,B 的同源物
HGNC 批准的基因符号:RAD54B
细胞遗传学位置:8q22.1 基因组坐标(GRCh38):8:94,371,960-94,475,115(来自 NCBI)
▼ 说明
RAD54B 是 SNF2/SWI2 超家族的成员(参见 600014),是参与 DNA 损伤重组修复的复合体的一部分。
▼ 克隆与表达
平本等人(1999) 描述了 SNF2 超家族成员的分离,其特征是与 DNA 和 RNA 解旋酶中的序列基序相似。该基因被命名为 RAD54B,与 RAD54 基因(603615) 显示出显着的同源性。 RAD54B cDNA 预计编码 910 个氨基酸的蛋白质。 Northern印迹分析检测到在睾丸和脾脏中高表达的3.2-kb转录物,它们在减数分裂和有丝分裂重组中活跃。
通过蛋白质印迹分析,Tanaka 等人(2000) 证明 RAD54B 在人前列腺癌细胞系和 3 种人乳腺癌细胞系中表达为 100-kD 蛋白质。免疫荧光分析显示,RAD54B 定位于这些细胞中整个核质的离散位点,并与 RAD51(179617)、RAD54 和 BRCA1(113705) 共定位。
▼ 基因功能
平本等人(1999) 表明 RAD54B 可能与 RAD52(600392) 上位组的其他成员一起在重组过程中发挥积极作用。
乳腺肿瘤易感基因产物 BRCA1 和 BRCA2(600185) 与 RAD51 重组蛋白的关联表明,癌症可能通过重组缺陷而产生。田中等人(2000) 证明 RAD54B 与 RAD54 一样,通过其 N 端结构域与 RAD51 关联。然而,与RAD54相反,RAD54与RAD51的结合是由电离辐射诱导的,他们在免疫沉淀实验中发现RAD54与RAD51组成型结合。此外,在酵母2-杂交测定中未能检测到RAD54B和RAD51之间的相互作用表明,与RAD54和RAD51之间的相互作用不同,它们的相互作用可能是间接的。
Miyakawa 等人使用 RAD54B 缺陷的人结肠癌细胞系(2002) 表明 RAD54B 在靶向整合中发挥着关键作用,而不影响细胞生长、对 DNA 损伤剂的敏感性或姐妹染色单体交换。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交分析,Hiramoto 等人(1999) 将 RAD54B 基因定位到与癌症相关染色体异常相关的区域中的 8q21.3-q22。在人类原发性淋巴瘤和结肠癌中观察到 RAD54B 高度保守位置的纯合突变。
▼ 分子遗传学
平本等人(1999) 在一组 54 种人类肿瘤中发现了 RAD54B 基因的 2 个突变,其中包括 26 种淋巴瘤和 19 种结直肠癌。
▼ 动物模型
库德尔等人(2004) 创建了 Rad54/Xrcc5(194364) 双突变小鼠,并确定同源重组和非同源末端连接成分协同修复 DNA 损伤。双突变小鼠的组织和细胞显示出自发的 DNA 损伤。作者得出的结论是,即使是轻微的修复缺陷也会在其他突变的背景下产生深远的影响。
米尔斯等人(2004) 创建了 Rad54/Lig4(601837) 双突变小鼠,并确定这些因子协同支持细胞增殖、修复自发双链断裂并防止染色体和单染色单体畸变。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、躯体疾病
RAD54B、ASN593SER
在一项对非霍奇金淋巴瘤病例原发组织的研究中(参见 605027),Hiramoto 等人(1999) 在将 asn 密码子 593 处的 RAD54B 基因中发现 A 到 G 的转变。该肿瘤中不存在野生型等位基因,表明该突变是纯合的。
.0002 结肠癌,体细胞
RAD54B、ASP418TYR
在结肠腺癌中发现的原发组织(参见 114500)中,Hiramoto 等人(1999) 在 RAD54B 基因中发现 G 到 T 的颠换,将密码子 418 处的 asp 转换为 tyr。该突变是纯合的(或半合的)。