蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体型，13； PTPN13
蛋白质酪氨酸磷酸酶 PTPL1
FAS 相关蛋白酪氨酸磷酸酶 1； FAP1
HGNC 批准的基因符号：PTPN13
细胞遗传学位置：4q21.3 基因组坐标（GRCh38）：4:86,594,315-86,815,161（来自 NCBI）
▼ 克隆与表达
Saras 等人使用基于 PCR 的方法（1994）克隆了非受体型细胞质蛋白酪氨酸磷酸酶，并将其命名为 PTPL1。重叠的 cDNA 克隆包含 7,398 bp 的开放解读码组，预测为 2,466 个氨基酸、分子量为 275 kD 的蛋白质。 PTPL1被发现具有广泛的组织分布，9.5-kb的转录物在大多数组织中表达。 PTPL1 的 C 末端有一个蛋白质酪氨酸磷酸酶结构域。在 PTPL1 的非酶促部分中，鉴定出 3 个不同的结构基序；其中 2 个经常出现在质膜和细胞骨架之间界面的蛋白质中，即与带 4.1（130500） 超家族相似的结构域，以及由 5 个拷贝的 80 个氨基酸重复序列组成的区域。多种细胞骨架相关蛋白。此外，PTPL1 具有亮氨酸拉链基序。萨拉斯等人（1994） 指出 PTPL1 是已知最大的 PTP，也是唯一已知含有亮氨酸拉链基序的 PTP。其结构表明它可能能够形成二聚体并可能定位于膜下细胞骨架。
班维尔等人（1994）和前川等人（1994） 分离出相同的非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶 PTPN13，他们分别将其称为 hPTP1E 和 PTP-BAS。前川等人（1994） 最初使用简并引物和 RT-PCR 从嗜碱性粒细胞 mRNA 中分离出 PCR 产物。将其用作筛选富含嗜碱性粒细胞的 KU812E 细胞 cDNA 文库的探针。完全表征的 cDNA 超过 8.1 kb，编码 2,485 个氨基酸的预测阅读框。班维尔等人（1994） 通过用 LAR cDNA 探针在低严格条件下筛选 ZR-75-1 乳腺癌细胞系来分离 cDNA（179590）。他们鉴定出的 cDNA 长度超过 8.3 kb，编码 2,490 个氨基酸的阅读框。两个小组都指出，N 末端区域包含与鸟苷酸激酶蛋白中发现的 GLGF 基序相似的基序，这些基序可能在这些蛋白质在发生细胞与细胞相互作用的细胞膜特殊结构内的亚细胞分布中发挥作用。前川等人（1994） 提出了选择性剪接产生至少 3 种不同 PTPN13 亚型的证据。班维尔等人（1994） 在大肠杆菌中表达该蛋白，并表明重组蛋白具有预期的蛋白酪氨酸磷酸酶活性。 Northern印迹分析显示在多种组织中表达，其中在肾、肺和胎儿脑中表达水平尤其高。
PTPN13 与 Fas 中的负调控域结合，抑制 Fas 诱导的细胞凋亡；因此它也被称为 Fas 相关蛋白酪氨酸-1（FAP1）（Inazawa 等人，1996）。
▼ 基因结构
吉田等人（2002） 确定 PTPN13 基因在头对头方向上仅位于 JNK3（602897） 上游 633 bp 处。两个基因帽位点之间的短 G/C 丰富区域表明它们可能共享一个似乎包含多个顺式元件的双向启动子区域。他们发现 PTPN13 基因包含 48 个外显子，在外显子 2 内启动转录，并在外显子 48 处终止。
▼ 测绘
班维尔等人（1994） 通过体细胞杂交 DNA 的 PCR 将 PTPN13 基因分配给染色体 11。在勘误表中，他们指出该基因被分配到染色体 4，而不是报道的染色体 11。
稻泽等人（1996） 通过荧光原位杂交和体细胞杂交体的 PCR 分析将 PTPN13 基因定位于 4q21.3。他们指出，4q21.3 染色体区域包含常染色体显性多囊肾病（173910） 的基因，并且在肝癌和卵巢癌中经常被删除。
van den Maagdenberg 等人确认了 4q21 的分配（1996） 他还将基因对应到小鼠染色体 5。
▼ 基因功能
黄等人（2008） 将 FAP1 鉴定为人类 U937 细胞中的 IRF8（601565） 靶基因。 IRF8 表达与 FAP1 表达以及 FAP1 对 U937 细胞中 FAS（134637） 诱导的细胞凋亡的抑制呈负相关。 IRF8 通过与 FAP1 近端启动子中的干扰素刺激反应元件（ISRE） 样序列相互作用来抑制 FAP1 的转录。这种相互作用在 U937 细胞分化过程中增强，并受到 IRF8 干扰素调节因子结构域中保守酪氨酸残基磷酸化的调节。
▼ 分子遗传学
王等人（2004） 对人类癌症中的酪氨酸磷酸酶基因超家族进行了突变分析，并鉴定了 6 种蛋白质酪氨酸磷酸酶中的 83 个体细胞突变（PTPRF，179590；PTPRG，176886；PTPRT，608712；PTPN3，176877；PTPN13；和 PTPN14，603155） ），影响 26% 的结直肠癌以及一小部分肺癌、乳腺癌和胃癌。十五种突变是无义突变、移码突变或剪接位点改变，预计会导致缺乏磷酸酶活性的截短蛋白质。王等人（2004） 通过生化检查了 PTPRT（最常见的蛋白质酪氨酸磷酸酶改变）中的 5 个错义突变，发现它们降低了磷酸酶活性。野生型而非突变型 PTPRT 在人类癌细胞中的表达抑制了细胞生长。王等人（2004） 得出的结论是，他们的观察表明突变的酪氨酸磷酸酶是肿瘤抑制基因，调节可能适合治疗干预的细胞途径。
