G蛋白偶联受体179; GPR179

GPR158-LIKE; GPR158L
GPR158L1

HGNC 批准的基因符号:GPR179

细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:38,324,571-38,343,956(来自 NCBI)

▼ 说明

G 蛋白偶联受体(GPCR) 构成一个大的蛋白质超家族,将细胞外信使分子和感觉刺激的信号传递到细胞内信号传导途径。 GPR179 属于 GPCR 的谷氨酸受体亚家族(Bjarnadottir 等,2005)。

▼ 克隆与表达

Bjarnadottir 等人通过搜索数据库寻找新型谷氨酸 GPCR(2005) 鉴定了 GPR179,他们将其称为 GPR158L。推导的 2,367 个氨基酸蛋白具有长 N 末端,后面是经典的 7 次跨膜结构域。比亚纳多蒂尔等人(2005) 还鉴定了小鼠 Gpr158l。

Audo 等人在 rd1 小鼠中,携带 Pde6b(180072) 突变,是自然发生的进行性视杆细胞感光细胞变性模型(2012) 分析了全视网膜转录组数据,观察到与野生型小鼠相比 Gpr179 的表达增加。实时PCR实验证实了GPR179在人视网膜中的表达,并且对视网膜扩增的RT-PCR产物进行Sanger测序证实了GPR179转录物的存在。

▼ 基因结构

比亚纳多蒂尔等人(2005)确定GPR179基因含有11个外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Bjarnadottir 等人(2005) 将 GPR179 基因定位到染色体 17q12。他们将小鼠 Gpr179 基因定位到 11 号染色体。

▼ 基因功能

Peachey 等人在 nob5 小鼠中,这种小鼠是 C3H 小鼠群体中的自发突变,并且在视网膜电图(ERG) 上没有 b 波(nob) 表型(2012) 进行了遗传图谱分析,然后对关键区域进行了新一代测序,并在 Gpr179 基因中检测到了一个大的转座子样 DNA 插入。斑马鱼中 gpr179 的功能性敲除导致 ERG b 波振幅显着降低。

奥多等人(2012) 指出他们将小鼠 Gpr179 定位到水平细胞和 Muller 细胞末端是错误的。他们的新结果支持了 Peachey 等人的平行研究的结论(2012) Gpr179 在视网膜双极细胞中表达。

▼ 分子遗传学

Audo 等人在来自 5 个无关家庭的 8 名完全先天性静止性夜盲症(CSNB1E; 614565) 患者中进行了研究(2012) 鉴定了受影响个体中 GPR179 基因突变的纯合性和复合杂合性(参见,例如 614515.0001-614515.0004)。

皮奇等人(2012) 分析了 44 名缺乏去极化双极细胞(DBC) 功能的 cCSNB 患者的候选基因 GPR179,并鉴定了 2 名具有 GPR179 失活突变复合杂合性的先证者(参见 614515.0005-614515.0007)。

▼ 等位基因变异体(7 个精选示例):

.0001 夜盲症,先天性固定,1E 型
GPR179、HIS603TYR

Audo 等人对来自黎巴嫩血统近亲家庭的 3 名患有完全先天性静止性夜盲症 1E 型(CSNB1E;614565)的同胞进行了研究(2012) 鉴定了 GPR179 基因外显子 9 中 1807C-T 转换的纯合性,导致在桥接第六和第七跨膜的外部环中的高度保守残基处发生 his603-to-tyr(H603Y) 取代。他们未受影响的父母是杂合突变,而在 366 名对照中未发现这种突变。

.0002 夜盲症,先天性固定,1E 型
GPR179,1-BP DEL,278C

在一名患有完全先天性静止性夜盲症 1E 型(CSNB1E;614565)的男性患者中,Audo 等人的近亲父母出生于葡萄牙血统(2012) 鉴定了 GPR179 基因外显子 1 中 1 bp 缺失(278delC) 的纯合性,预计会引起移码,导致过早终止密码子。他未受影响的父母的缺失是杂合的,而在 366 名对照中未发现这种情况。

.0003 夜盲症,先天性固定,1E 型
GPR179、ARG200TER

在 2 名患有完全先天性静止性夜盲症 1E 型(CSNB1E;614565)的法国姐妹中,Audo 等人(2012) 鉴定了 GPR179 基因外显子 1 中 598C-T 转变的复合杂合性,预计会导致移码导致提前终止密码子,以及内含子 8 中的 G-A 剪接位点转变(1784+1G-A; 614515.0004) 。他们未受影响的父母均具有其中一种突变的杂合子;在 378 个对照中没有发现这两种突变。

.0004 夜盲症,先天性固定,1E 型
GPR179、IVS8、G-A、+1

讨论 Audo 等人在患有完全先天性静止性夜盲症 1E 型(CSNB1E;614565)的同胞中以复合杂合状态发现的 GPR179 基因剪接位点突变(1784+1G-A)(2012),参见 614515.0003。

.0005 夜盲症,先天性固定,1E 型
GPR179,1-BP DEL,984C

Peachey 等人在 2 名患有完全先天性静止性夜盲症 1E 型(CSNB1E;614565)的无关先证者中(2012) 鉴定了 GPR179 基因中 1-bp 缺失(984delC) 的复合杂合性,预计会导致蛋白质过早截短,以及另一个突变:在 10 岁男性先证者中,第二个突变是另一个 1-bp缺失(187delC;614515.0006)也预测会导致蛋白质过早截短,而在挪威血统的 20 岁女性先证者中,第二个突变是 659A-G 转变,导致 tyr220 到 cys(Y220C; 614515.0007) 替代。该男孩未受影响的父母均携带他所携带的一种突变的杂合子;无法获得另一名先证者父母的 DNA。在 210 条对照染色体中均未发现这 3 个突变。

.0006 夜盲症,先天性固定性,1E 型
GPR179,1-BP DEL,187C

讨论 Peachey 等人在患有完全先天性静止性夜盲症 1E 型(CSNB1E; 614565) 的患者中以复合杂合状态发现的 GPR179 基因(187delC) 中的 1-bp 缺失(2012),参见 614515.0005。

.0007 夜盲症,先天性固定,1E 型
GPR179、TYR220CYS

Peachey 等人讨论了 GPR179 基因中的 tyr220-to-cys(Y220C) 突变,该突变在完全先天性静止性夜盲症 1E 型(CSNB1E; 614565) 患者的复合杂合状态下发现(2012),参见 614515.0005。