茎环结合蛋白; SLBP

发夹结合蛋白、组蛋白;HBP

HGNC 批准的基因符号:SLBP

细胞遗传学位置:4p16.3 基因组坐标(GRCh38):4:1,692,731-1,712,319(来自 NCBI)

▼ 说明

茎环结合蛋白(SLBP),也称为发夹结合蛋白,特异性识别后生动物复制依赖性组蛋白 mRNA 上存在的保守茎环,以调节组蛋白 mRNA 代谢,也是成熟细胞的输出、稳定性和转录所必需的。 mRNA(Tan 等人的总结,2013)。

▼ 克隆与表达

后生动物复制依赖性组蛋白 mRNA 没有 Poly(A) 尾,而是以高度保守的 26 bp 序列结尾,其中包含茎环结构。该结构是组蛋白 mRNA 转录后加工所必需的,并参与组蛋白 RNA 代谢。发夹结合蛋白(HBP),也称为茎环结合蛋白,已被证明可以结合组蛋白 mRNA 的茎环结构。 Wang 等人使用酵母 3 杂交系统(1996)和马丁等人(1997)孤立克隆了编码HBP的cDNA。 HBP 是一种 270 个氨基酸的蛋白质,不包含任何先前描述的 RNA 结合结构域。它与小鼠和青蛙 Hbp 分别具有 89% 和 60% 的序列同一性。 HBP 的计算质量为 31 kD,低于 SDS-PAGE 估计的 43 至 45 kD,Wang 等人(1996) 将这种差异归因于 SDS-PAGE 上 HBP 的异常迁移率。通过 Northern blot 分析,Martin 等人(1997) 在所有检查的人体组织中检测到大约 2 kb 的 HBP 转录本。

▼ 基因功能

王等人(1996) 表明 HBP 是核和多核糖体提取物中的主要蛋白质,可特异性结合组蛋白 mRNA 茎环结构。他们将 HBP 的新型 RNA 结合结构域定位到 73 个氨基酸区域。王等人(1996)和马丁等人(1997) 证明 HBP 是有效组蛋白前体 mRNA 加工所必需的,并预测它参与组蛋白 RNA 代谢的许多方面。

▼ 基因结构

马丁等人(1997)发现HBP基因有8个外显子,覆盖约19.5 kb。

▼ 测绘

马丁等人(1997) 通过核苷酸序列比较发现,HBP 的基因组区域先前在寻找染色体 4p16.3 上的亨廷顿病基因座时已被测序。

▼ 生化特征

晶体结构

谭等人(2013) 报道了人 SLBP RNA 结合结构域、人 3-prime-HEXO(ERI1; 608739) 和 26 核苷酸茎环 RNA 的三元复合物的晶体结构。茎环中只有 1 个碱基被 SLBP 特异性识别,这 2 个蛋白质主要识别 RNA 的形状。 SLBP和3-prime-HEXO彼此没有直接接触,并且诱导茎环环的结构变化介导它们的协同结合。 3-prime 侧翼序列位于 3-prime-HEXO 活性位点,但三元复合物限制了修剪的程度。