GARP 复合体的 VPS52 亚基； VPS52

液泡蛋白分选 52，酿酒酵母，同源物
肌动蛋白突变 2 的抑制子，酿酒酵母，同源样； SACM2L

HGNC 批准的基因符号：VPS52

细胞遗传学位置：6p21.32 基因组坐标（GRCh38）：6:33,250,272-33,271,965（来自 NCBI）

▼ 说明

VPS52 是高尔基体相关逆行蛋白复合物（GARP） 的一部分，参与早期和晚期内体向晚期高尔基体的逆行转运。 GARP 蛋白与 RAB 蛋白（例如 RAB6A；179513）和 SNARE 蛋白（例如 STX6；603944）相互作用（Liewen 等，2005）。 VPS52 也是内体相关回收蛋白（EARP） 复合物的一个组成部分，其功能是将内吞囊泡回收回质膜（Schindler et al., 2015）。

▼ 克隆与表达

通过对主要组织相容性复合物（MHC） 着丝粒部分的克隆区域进行序列分析，Walter 和 Gunther（1998） 鉴定了一个新的大鼠基因。预测的蛋白质被命名为 Sacm21（肌动蛋白突变 2 样抑制蛋白），因为它与酿酒酵母 Sac2（肌动蛋白突变 2 样抑制蛋白）具有 20% 的序列同一性。通过搜索 EST 数据库，作者鉴定出人类和小鼠 cDNA 编码的同源蛋白与大鼠 Sacm2l 分别有 95% 和 98% 的同一性。 Walter 和 Gunther（1998） 使用引物延伸，绘制了人和大鼠 SACM2L 的多个转录起始位点。

通过在数据库中搜索酵母 Vps52 的同源物，Liewen 等人（2005） 鉴定出人类 VPS52。全长人类蛋白含有 N 端卷曲螺旋结构域。作者还鉴定了编码缺少氨基酸 313 至 374 的亚型的剪接变体。COS-7 细胞的免疫荧光显微镜显示 Vps52、Vps53（615850） 和 Vps54（614633） 表达与高尔基体蛋白 Gm130（GOLGA2; 602580） 重叠）在极化的核周区域，并在核周包膜处具有内体标记 Mpr（参见 IGF2R，147280）和 Tfr（190010）。犬细胞的亚细胞分离实验在平滑膜/高尔基体部分中检测到 3 种 VPS 蛋白，但在细胞质中未检测到。

▼ 基因功能

通过免疫共沉淀分析，Liewen 等人（2005） 发现人类 VPS52 与人类 VPS53 和 VPS54 相互作用。 RAB6B（615852） 和 STX10（603765） 的短亚型可免疫沉淀 VPS52，但不能免疫沉淀 VPS53 或 VPS54。

Schindler 等人使用生化和蛋白质相互作用测定（2015） 发现 3 个 GARP 复合体成分 ANG2（VPS51; 615738）、VPS52 和 VPS53 形成了一个独特的复合体，称为 EARP 复合体，其中 Syndetin（VPS50; 616465） 取代了 GARP 成分 VPS54。 4 个 EARP 组件以 1:1:1:1 的比例相互作用。 Syndetin 不与 VPS54 相互作用，但酵母 2-杂交分析表明 Syndetin 和 VPS54 均优先与 VPS53 相互作用。通过小干扰 RNA 敲低 HeLa 细胞中 EARP 复合物中的任何蛋白质，都会减少所有其他复合物成分的量。表达标记蛋白的大鼠海马神经元的共聚焦免疫荧光显微镜和转染的 HeLa 细胞的活细胞成像表明，突触蛋白决定了 EARP 复合物定位于 RAB4A（179511） 阳性回收内体，而 VPS54 决定了 GARP 复合物定位于反式-高尔基体网络。功能分析表明，EARP 复合物促进内化转铁蛋白受体（TFRC；190010）再循环到细胞表面。辛德勒等人（2015） 的结论是，EARP 复合体参与内吞再循环过程中的典型膜融合事件。

▼ 测绘

Walter 和 Gunther（1998） 使用基因组克隆的 PCR 分析发现，在小鼠、大鼠和人类中，SACM2L 和 RPS18（180473） 基因以头对头的方向排列，且起始位点以 444- 间隔分开。 482bp。 RPS18 基因位于 MHC 内的 6p21.3（AL031228），将 SACM2L 基因置于同一区域。