TAF4B RNA 聚合酶 II,TATA 框结合蛋白相关因子,105-KD; TAF4B
TATA 框结合蛋白相关因子 C2; TAF2C2
TBP 相关因子,RNA 聚合酶 II,105-KD; TAFII105
HGNC 批准的基因符号:TAF4B
细胞遗传学位置:18q11.2 基因组坐标(GRCh38):18:26,226,445-26,391,685(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
TATA 结合蛋白相关因子(TAF) 与 TATA 结合蛋白(TBP; 600075) 一起参与 TFIID 蛋白复合物的形成(参见 313650),该复合物参与 RNA 聚合酶 II 基因转录的启动(参见 180660)。迪克斯坦等人(1996) 报道分化的 B 细胞含有一种新型的 105 kD 亚化学计量 TAF,未发现与从其他细胞类型分离的 TFIID 相关。他们纯化了该蛋白质(他们称之为 TAFII105),并使用根据蛋白质序列设计的 PCR 引物从 Daudi 细胞 cDNA 文库中克隆了人类基因。 cDNA 揭示了 TAFII130(TAF2C) 和 TAFII110 共有的高度保守的 C 端结构域以及不同的 N 端共激活结构域。所有测试的细胞都表达 TFII105 mRNA,但只有 B 细胞含有显着水平的与 TFIID 相关的蛋白质。 Dikstein 等人向 Dikstein 等人提出了该蛋白质的这些特性和其他特性(1996) TAFII105 是 TFIID 的细胞类型特异性亚基,可能负责介导 B 细胞中激活剂子集的转录。另请参见 TAF2C1(601796)。
▼ 测绘
Gross(2020) 根据 TAF4B 序列(GenBank AK302593) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TAF4B 基因对应到染色体 18q11.2。
▼ 基因功能
Gustafson 等人使用酵母 2-杂交分析(2020) 鉴定 Zfp628(610671) 是小鼠中与 Taf4b 相互作用的转录辅助因子。内源性 Zfp628 与小鼠睾丸分离蛋白中的 Taf4b 共免疫沉淀。与 Taf4b 突变体一样,Zfp628 缺陷的雄性小鼠是不育的。
▼ 分子遗传学
在一个土耳其近亲家庭中,8 个兄弟中有 4 个因生精障碍而不育(SPGF13;615841),Ayhan 等人(2014) 鉴定了 TAF4B 基因(R611X; 601689.0001) 中的无义突变的纯合性,该突变与家族中的疾病分离,而在对照中未发现该突变。
▼ 动物模型
弗莱曼等人(2001) 通过有针对性的破坏产生了 TAFII105 缺陷的小鼠。缺乏 TAFII105 的雌性小鼠可以存活,但不能生育,因为卵泡发生缺陷与卵巢卵泡颗粒细胞中 TAFII105 的表达受限相关。弗莱曼等人(2001) 使用基因表达谱揭示了 TAFII105 缺陷卵巢中存在缺陷的抑制素激活素信号通路。总之,这些研究表明 TAFII105 介导卵巢中正常卵泡发生所需的基因子集的转录,并将 TAFII105 确立为哺乳动物转录机制的细胞类型特异性组件。 TAFII105 缺陷的卵巢显示以下基因的表达降低:抑制素 β-B(147390)、芳香酶 p450、抑制素 β-A(147290)、细胞周期蛋白 D2(123833)、17-β 羟基类固醇脱氢酶 I(109684)、卵泡抑素(136470) ) 和抑制素-α(147380)。
法兰德等人(2005) 发现雄性 Taf4b-null 小鼠最初具有生育能力,但在 3 个月大时变得不育,并最终表现出生殖细胞丧失和睾丸退化。出生时,Taf4b 缺失的雄性睾丸组织学表现正常;然而,在出生后第 3 天,生殖母细胞增殖受损,精原干细胞标记物 Ret(164761)、Plzf(ZNF145; 176797) 和 Stra8(609987) 的表达减少。法兰德等人(2005) 得出结论,TAF4B 是调节成人精原干细胞的规范和增殖所必需的。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 生精失败 13(1 个家族)
TAF4B、ARG611TER
Ayhan 等人在来自高度近亲土耳其家庭的 4 名患有生精障碍的不育兄弟中(SPGF13; 615841)(2014) 鉴定了 TAF4B 基因外显子 9 中 c.1831C-T 转变的纯合性,导致 arg611 到 ter(R611X) 取代。该突变预计会截短 252 个残基,并导致蛋白质缺乏组蛋白折叠结构域以及 TAF12(600773) 相互作用结构域。一位未受影响的兄弟有 9 个孩子,其突变是杂合的,而在 120 个对照人群中未发现这种突变。