ANGEL同系物2; ANGEL2

天使，果蝇，同源物，2
CCR4，酿酒酵母，D 的同源物； CCR4D

HGNC 批准的基因符号：ANGEL2

细胞遗传学位置：1q32.3 基因组坐标（GRCh38）：1:212,992,182-213,015,867（来自 NCBI）

▼ 说明

由于核酸内切酶切割、核酸外切酶修剪或从头合成，RNA 分子经常被末端 2-prime、3-prime-环状磷酸基团修饰。 ANGEL2 是一种磷酸酶，可将 2-prime,3-prime-环状磷酸酯转化为 2-prime,3-prime-羟基核苷酸（Pinto et al., 2020）。

▼ 克隆与表达

易等人（2012） 从乳腺 cDNA 文库中克隆了人类 ANGEL2，他们将其称为 CCR4D。推导的 544 个氨基酸蛋白具有假定的 RNA 结合位点和一个跨越残基 169 至 542 的 EEP 结构域。CCR4D 在进化上非常保守，在拟南芥、线虫、斑马鱼、鸡和哺乳动物中具有直向同源物。人类和黑猩猩 CCR4D 具有 100% 的氨基酸同一性。 Northern 印迹分析检测到 4.6 kb 转录物在人体组织和细胞系中广泛表达。蛋白质印迹分析显示 65 kD 蛋白质在人类细胞系中广泛表达。

▼ 测绘

Gross（2020） 根据 ANGEL2 序列（GenBank BC047469） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 ANGEL2 基因对应到染色体 1q32.3。

▼ 基因功能

Yi 等人使用 MCF7 人类乳腺癌细胞和其他人类癌细胞系（2012） 表明，CCR4D 通过以 p53（TP53; 191170） 孤立的方式上调细胞周期抑制剂 p21（CDKN1A; 116899） 的表达来抑制细胞增殖并阻断 G1-S 转变。 CCR4D 通过结合 p21 转录本的 3-prime-UTR 来稳定 p21 转录本，从而增强 p21 表达。 Northern 印迹分析表明，CCR4D 在各种人类肿瘤样本中表达下调。

在哺乳动物细胞中，前 tRNA 被 tRNA 剪接核酸内切酶复合物（参见 608757）切割，生成 2 个半外显子，其中 5 素外显子包含 2 素、3 素环磷酸基团，3 素外显子包含 2 素、3 素环磷酸基团和 3 素外显子。含有 5-素羟基的外显子。随后，两半通过 tRNA 连接酶复合物（参见 613901）连接形成成熟的 tRNA。平托等人（2020）发现人ANGEL2与tRNA连接酶复合物竞争底物，并通过从5-prime tRNA外显子半部去除2-prime、3-prime-环状磷酸基团来抑制体外成熟tRNA的形成。 ANGEL2 还通过类似的机制干扰 XBP1（194355） mRNA 剪接。此外，ANGEL2去除了末端2-prime、3-prime-环状磷酸基团，生成3-prime羟基，用于重新添加CCA序列，以在核糖体停滞后回收受损的tRNA。

▼ 生化特征

平托等人（2020） 分别以 1.45 埃和 2.10 埃的分辨率确定了 ANGEL2 的 EEP 结构域（氨基酸 119 至 544）的 apo 和底物结合形式的晶体结构。 ANGEL2采用了EEP家族蛋白典型的保守的2层α/β夹心折叠，EEP结构域的核心由2个保守的β折叠形成，并被2个外层的α螺旋和环包围。 ANGEL2的活性位点含有1个Mg（2+）离子。基于结构和突变分析，作者提出了一种具有二素磷酸反应中间体的两步催化机制。第一步需要单个 Mg（2+） 离子来配位 2-素数、3-素数环状磷酸基团和水亲核试剂并稳定过渡态。