软骨素聚合因子; CHPF
硫酸软骨素合成酶2; CSS2
HGNC 批准的基因符号:CHPF
细胞遗传学位置:2q35 基因组坐标(GRCh38):2:219,538,954-219,543,809(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过数据库检索,以CHSY1(608183)序列为探针,Kitakawa等人(2003)分离CHPF。推导的 775 个氨基酸蛋白质的预测分子量约为 85 kD,并包含 3 个潜在的 N-糖基化位点。 CHPF 具有显着的 N 末端疏水片段,预计是 II 型跨膜蛋白。 CHPF 与硫酸软骨素葡萄糖醛酸转移酶(CSGlcAT;608037) 和 CHSY1 分别具有 57% 和 23% 的序列同一性。 Northern 印迹分析在除外周血白细胞外的所有检查组织中检测到 3.4-kb CHPF 转录物;在胎盘和心脏中检测到高水平的 CHPF 表达,在脑、骨骼肌、肾脏和肝脏中检测到中等水平的 CHPF 表达。
雅达等人(2003)以CSGlcAT序列为探针,通过数据库检索,孤立分离出CHPF,将其称为CSS2。尽管北川等人。 Yada 等人(2003) 指出 CHPF 缺乏大多数糖基转移酶中发现的保守 DXD 基序(2003) 鉴定了蛋白质 N 末端的 DXD 基序和 β-1,3-糖基转移酶中保守的另一个基序。实时定量PCR分析检测到CHPF在所有检查组织中表达,其中在胰腺、卵巢、胎盘、小肠和胃中表达最高。
▼ 基因功能
北川等人(2003) 发现可溶性重组形式的 CHPF 在 COS-1 细胞中的表达产生了一种几乎没有葡萄糖醛酸转移酶(GlcAT-II) 或 N-乙酰半乳糖胺转移酶(GalNAcT-II) 活性的蛋白质,负责软骨素重复二糖单元的生物合成硫酸盐。然而,CHPF 和 CHSY1 的共表达显着增强了糖基转移酶活性,而两种单独表达的蛋白质的简单混合却没有。当 GlcUA 和 GalNAc 都用作糖供体时,在 α-血栓调节蛋白的所谓糖胺聚糖-蛋白质连接区四糖序列上证实了软骨素聚合。北川等人(2003) 得出结论,软骨素聚合活性需要 CHPF 与 CHSY1 的同时表达。
在 COS-7 细胞中使用可溶性重组形式的 CHPF 进行的实验中,Yada 等人(2003)发现CHPF表现出双重GlcAT-II和GalNAcT-II糖基转移酶活性。他们得出结论,CHPF 在硫酸软骨素链合成中发挥作用。
▼ 基因结构
CHPF 基因包含至少 4 个外显子,跨度超过 5 kb(Kitakawa 等,2003;Yada 等,2003)。
▼ 测绘
通过序列分析,北川等人(2003) 将 CHPF 基因定位到染色体 2q35-q36。通过同样的方法,Yada 等人(2003) 将基因定位到 2q36.1。