A-激酶锚定蛋白 2; AKAP2

AKAPKL
KIAA0920

此条目中涉及的其他实体:
包含 PARALEMMIN 2; PALM2,包含
包含 PALM2-AKAP2 转录本

HGNC 批准的基因符号:PALM2AKAP2

细胞遗传学位置:9q31.3 基因组坐标(GRCh38):9:109,640,787-110,172,512(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

使用酵母 2-杂交筛选,Dong 等人(1998)分离了编码小鼠 Akap2 的 6 个亚型的 cDNA,他们将其命名为 Akapkl,因为它在肾和肺的上皮细胞中表达。该同工型包含 671 至 885 个氨基酸,是通过选择性剪接和使用 2 个起始密码子之一生成的。通过组织部分的免疫印迹分析,Dong 等人(1998)发现Akapkl在肺中大量表达,在胸腺和小脑中中等表达,但在心脏、大脑皮层和肝脏中缺失。共聚焦免疫荧光显微镜显示,在转染的人胚胎肾细胞中,Akapkl 与 F-肌动蛋白(参见 102610)相关,在皮质细胞骨架区域中积累。

Nagase 等人通过对从大小分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1999) 克隆了 AKAP2,他们将其命名为 KIAA0920。推导的蛋白质含有1,103个氨基酸。 RT-PCR ELISA 检测到肺中 AKAP2 高表达,所有其他组织和所检查的特定脑区域中表达中等。

胡等人(2001) 鉴定了 AKAP2 序列编码的 4 种主要蛋白质产物。第一个源自 AKAP2 的前 8 个外显子,编码 Hu 等人 441 个氨基酸的蛋白质(2001) 由于与 PALM1(608134) 相似而指定 PALM2。第二个 AKAPKL 源自 AKAP2 的最后 4 个外显子,对应于 Dong 等人报道的小鼠 Akapkl 亚型(1998)。第三个是 AKAP2,包含 PALM2 的 N 端一半和 AKAPKL 的全部,对应于 Nagase 等人报道的 KIAA0920 蛋白(1999)。第四个是 PALM2-AKAP2,包含几乎所有 PALM2 和 AKAPKL 序列。 RT-PCR 检测心脏、骨骼肌和成纤维细胞中 PALM2 的表达。 PALM2-AKAP2 在成纤维细胞中检测到,但在心脏或骨骼肌中未检测到。数据库分析确定了猴子、大鼠和小鼠中可能的 PALM2-AKAP2 直向同源物。由于人类基因组中的其他 PALM 基因附近没有 AKAPKL 样序列,并且 PALM2 和 AKAPKL 转录物是由各自孤立的启动子产生的,Hu 等人(2001) 表明 PALM2 和 AKAP2/AKAPKL 是两个不同的基因,它们通过 RNA 通读和差异剪接表达嵌合 mRNA。

▼ 基因功能

Dong 等人使用亲和层析和蛋白质印迹分析(1998) 表明小鼠 Akapkl 在完整细胞中结合 II 型蛋白激酶 A(PKA;参见 176911)。

▼ 基因结构

胡等人(2001) 将 AKAP2 描述为 2 个孤立的基因:PALM2 和 AKAP2/AKAPKL。前 8 个外显子编码 PALM2,后面是 2 个具有功能启动子的替代非编码外显子和 4 个编码 AKAPKL 的编码外显子。

▼ 测绘

Nagase 等人使用辐射杂交分析。 Hu 等人(1999) 将 AKAP2 基因定位到 9 号染色体。通过基因组序列分析,Hu 等人(2001) 将 AKAP2 基因定位到染色体 9q31-q33。他们将小鼠 Akap2 基因定位到 4 号染色体上。

▼ 分子遗传学

Li等人通过对一个4代中国家庭的全外显子组测序分离出了常染色体显性遗传性青少年特发性脊柱侧凸(2016) 鉴定了 c.2645A-C 颠换(c.2645A-C, ENST00000434623) 的杂合性,导致保守残基处发生 glu822-to-ala(E822A) 取代。该变异与家族中的表型分离,并且在 dbSNP(版本 144)、1000 基因组计划和外显子组变异服务器数据库以及 503 个群体匹配对照中不存在。对 2 名患者的淋巴细胞进行的 QPCR 分析显示,与 4 名对照者的淋巴细胞相比,AKAP2 mRNA 表达有所增加。然而,徐等人(2017) 在 1,254 名中国青少年特发性脊柱侧凸患者中未发现 c.2645A-C 变异。 33 名患者血液中 AKAP2 的表达水平与 18 名对照者相当。