MYCN 上游转录,非编码; MYCNUT
MYCN 上游的长非编码 RNA
lncUSMYCN
HGNC 批准的基因符号:MYCNUT
细胞遗传学位置:2p24.3 基因组坐标(GRCh38):2:15,920,399-15,936,018(来自 NCBI)
▼ 说明
长非编码 RNA(lncRNA),例如 MYCNUT,经常参与转录调控(Liu et al., 2014)。
▼ 克隆与表达
2 号染色体的 130 kb 区域包含 MYCN 基因(164840),在神经母细胞瘤中经常被扩增。刘等人(2014) 鉴定了 MYCNUT,他们将其命名为 lncUSMYCN,位于扩增区域内 MYCN 基因的上游。 RT-PCR 显示成熟的剪接转录本包含 1,039 bp。
▼ 基因功能
刘等人(2014) 发现 lncUSMYCN 在原代神经母细胞瘤和神经母细胞瘤细胞系的子集中与 MYCN 共扩增。仅在少数未显示 MYCN 扩增的神经母细胞瘤中,lncUSMYCN 的表达上调。通过小干扰RNA敲低lncUSMYCN会降低人神经母细胞瘤细胞系中MYCN mRNA的表达,而lncUSMYCN的异位表达会上调外源性MYCN mRNA并诱导细胞增殖。与其他lncRNA不同,lncUSMYCN不直接调节MYCN启动子活性,而是直接与RNA结合蛋白NONO(300084)结合,从而增加MYCN表达。神经母细胞瘤组织中的高 lncUSMYCN 或 NONO 表达孤立预测患者预后不良。 lncUSMYCN 的敲低降低了神经母细胞瘤小鼠的肿瘤生长。
▼ 基因结构
刘等人(2014) 确定 MYCNUT 基因包含 3 个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,刘等人(2014) 将 MYCNUT 基因对应到染色体 2p24.3,它位于 MYCN 基因的上游。