转录终止因子2; TTF2

转录终止因子,RNA 聚合酶 II

HGNC 批准的基因符号:TTF2

细胞遗传学位置:1p13.1 基因组坐标(GRCh38):1:117,060,326-117,107,453(来自 NCBI)

▼ 说明

TTF2 是一种 ATP 依赖性 RNA 聚合酶 II 转录终止因子(Liu et al., 1998)。

▼ 克隆与表达

转录延伸是控制真核基因表达的重要目标。从启动子启动后,RNA 聚合酶 II 延伸复合物在 N-TEF(负转录延伸因子)成分的作用下受到阻断延伸。 N-TEF 的一种成分,果蝇因子 2,通过以 ATP 依赖性方式终止转录来抑制长 RNA 聚合酶 II 转录物的生成。通过几种不同的机制导致转录终止功能的蛋白质因子。 Factor-2 似乎使用的一种机制涉及与 DNA 和/或 RNA 聚合酶结合,并利用 DNA 依赖性 ATP 酶活性将聚合酶复合物从 DNA 模板上解离。刘等人(1998) 发现果蝇因子 2 与“lodestar”相同。首先被鉴定为参与有丝分裂过程中染色体分离的母体效应蛋白。 Lodestar 是 SWI2/SNF2 蛋白质家族的成员,参与转录、重组和修复过程中蛋白质-DNA 相互作用的调节。通过使用果蝇因子2的蛋白质序列作为查询来搜索EST数据库,Liu等人(1998) 鉴定了几种同源的人类 EST。他们利用 PCR 生成了编码人类因子 2(TTF2)的全长 cDNA。推导的 990 个氨基酸的 TTF2 蛋白与果蝇因子 2 具有 43% 的氨基酸序列同一性。这些蛋白质包含解旋酶超家族 1 和 2 中发现的 7 个基序; 7 个仅由 SWI2/SNF2 家族成员共享的额外基序; SWI2/SNF2 家族中不保守的 3 个保守基序和核定位信号。

▼ 基因功能

刘等人(1998) 发现,与果蝇因子 2 类似,重组人 TTF2 显示出强大的双链 DNA 依赖性 ATP 酶活性,该活性受到单链 DNA 的抑制,并表现出 RNA 聚合酶 II 终止活性。刘等人(1998) 讨论了因子 2 的终止机制以及因子 2 在细胞活动中的作用的影响。

▼ 测绘

Gross(2021) 根据 TTF2 序列(GenBank AF073771) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TTF2 基因对应到染色体 1p13.1。