锌指 MYND 结构域蛋白 8; ZMYND8

蛋白激酶 C 结合蛋白 1; PRKCBP1
RACK7

HGNC 批准的基因符号:ZMYND8

细胞遗传学位置:20q13.12 基因组坐标(GRCh38):20:47,209,214-47,356,699(来自 NCBI)

▼ 说明

ZMYND8 的结构域表明它参与细胞信号传导和肌动蛋白动力学(Fossey et al., 2000)。

▼ 克隆与表达

Fossey等人使用针对RACK1(GNB2L1;176981)的单克隆抗体筛选人海马cDNA文库,然后进行5-prime EST步行和5-prime RACE(2000) 克隆了 ZMYND8,他们将其称为 PRKCBP1。推导的 615 个氨基酸蛋白具有神经丝和细胞骨架蛋白中保守的 N 端基本结构域、推定的 C4 型锌指基序和 C 端 WD40 序列。 Northern 印迹分析在所有检查的人体组织中检测到 3.1 kb 的转录物,其中在脑、肺、胰腺和胎盘中表达最高。 RT-PCR 和 EST 数据库分析表明 ZMYND8 表达无处不在。

▼ 基因功能

Fossey 等人使用免疫沉淀和蛋白质下拉分析(2000)表明PRKCBP1的C端WD40结构域与PKC-β-1特异性相互作用(PRKCB1;176970)。

FHOD1(606881) 调节基因转录、肌动蛋白细胞骨架结构和细胞迁移。 Westendorf 和 Koka(2004) 使用酵母 2-杂交筛选人骨髓 cDNA 表达文库,发现 FHOD1 与 PRKCBP1 的中心部分以及亲环蛋白 B(PPIB; 123841) 和 WISH 的 B 同工型相互作用(NCKIPSD;606671)。

Shen 等人通过确定人类乳腺癌细胞中 RACK7 结合基因组位置的染色质景观(2016)发现RACK7和KDM5C(314690)占据了许多活性增强子位点,包括几乎所有的超级增强子。 RACK7 或 KDM5C 的缺失导致增强子过度激活,其特征是组蛋白 H3(参见 602810)lys4 三甲基化(H3K4me3) 和 H3K27 乙酰化(H3K27Ac) 的沉积以及 H3K4me1 的缺失,以及增强子 RNA 和附近基因的转录增加。 RACK7 的缺失显着损害了 KDM5C 向增强子的募集。缺乏RACK7或KDM5C的人乳腺癌细胞在体外表现出增强的贴壁依赖性生长、迁移和侵袭能力,以及在小鼠异种移植模型中增强的肿瘤生长。沉等人(2016) 得出的结论是,主动增强子受到负调控,RACK7 和 KDM5C 一起充当“制动器”。通过控制 H3K4me1 和 H3K4me3 之间的动态交换来获得活性增强子。

▼ 基因结构

福西等人(2000) 确定 ZMYND8 基因包含 9 个编码外显子,跨度超过 34 kb。

▼ 测绘

通过辐射杂交和基因组序列分析,Fossey 等人(2000) 将 ZMYND8 基因对应到染色体 20q12-q13.1。

Gross(2014) 根据 ZMYND8 序列(GenBank AF233453) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ZMYND8 基因对应到染色体 20q13.12。